山東財經大學比較好。
1、從地理位置上看
明顯山東財經大學占據優勢，位於省會濟南，雖然吸引力不及省內青島，但是終究是個省會；而安徽財經大學位於蚌埠，在安徽經濟排名也相對靠後，地理位置是個相對劣勢，不過好在蚌埠是交通樞紐，還是比較方便的。
2、從學校歷史上看
山東財經大學：創建於1952年，時名山東財經學院，1978年恢復辦學並更名為山東經濟學院，2011年教育部同意山東經濟學院與山東財政學院合並籌建山東財經大學，2012年3月2日，教育部正式公示山東財經大學“去籌”成功。
安徽財經大學：創建於1959年，時名安徽財貿學院，後1961年搬至蚌埠，1965年學校劃轉中華全國供銷合作總社主管，更名為安徽商學院。文革期間，學校先後更名為安徽省財經學校、安徽省供銷商業學校，1992年9月，安徽財貿學院、安徽商業管理幹部學院重組成新的安徽財貿學院，學校先後隸屬於中華全國供銷合作總社、商業部、國內貿易部，2004年更名安徽財經大學。
3、從學科專業設置看
山東財經大學：學校以經濟學和管理學科為主，兼有文學、法學、理學、工學、教育學、藝術學八大學科門類，設有23個教學院（部），61個本科專業；10個壹級學科碩士學位授權點，73個二級學科碩士學位授權點，14個專業學位授權點；3個壹級學科博士學位授權點，15個二級學科博士學位授權點。
安徽財經大學：是壹所以經、管、法學為主，跨文學、理學、工學、史學、藝術學八大學科門類的多學科性高等財經院校。現設有12個學院，1個教學部，29個校級研究機構，62個本科專業；8個壹級學科碩士學位授權點，39個二級學科碩士學位授權點，13個專業碩士學位授權點。
4、從師資力量上看
山東財經大學：有專任教師1865人，其中教授、副教授989人，教師中有國家級有突出貢獻的專家3人，享受國務院政府特殊津貼的專家16人，“泰山學者”崗位8個。
安徽財經大學：有專任教師994人，具有高級職稱教師453人，國務院特殊津貼專家和省政府特殊津貼專家18，全國優秀教師4人。