《澳門日報》每天出本埠版10至16大張、外埠版9至12大張，通常16至20版是全彩版。主要版面有：“澳門新聞”、“中國新聞”、“香港新聞”、“臺灣新聞”、“國際新聞”、“經濟新聞”、“娛樂新聞”、“體育新聞”和副刊“新園地”、“小說”等；其他專版有“鏡海”（文藝）、“學海（學術）、“生活”“鄉情”、“航運”、“科技”、“姿彩”、“汽車”、“食經”、“萬花筒”、“樂與聲”、“新兒童”、“三棱鏡”、“繽紛集”、“澳門街”、“大千世界”、“祝君健康”（醫藥）、“環遊世界”、“Net人天地”（網上資訊）、“環宇縱橫”、“新聞圖輯”、“生產力論壇”、“旅遊嘆世界”等。除日報外，還出版專業性的定期刊物《澳門馬經》（每周兩次）和《世界波經》（周刊）。副刊的業績在《澳門日報》是非常突出的，其中不少具有開拓性、首創性。到今天，《澳門日報》的副刊內容涵蓋了社會生活的各個方面，大多以揭示當代人的生活為主題，也有介紹中國古代文化和當代文學，以及傳統習俗等文藝性較強的文章。其中在副刊發表的生活絮語、詩歌、散文、小說等多種文體，反映了澳門社會的現實，透視出澳門人多姿多彩的人生。
言論是報紙的靈魂。《澳門日報》創刊以後，就壹直設有社論、專論和讀者來信來稿等針砭時弊的欄目。《澳門日報》創刊伊始就為自己的言論樹立了旗幟：愛國、和平、人道、進步。常設的言論專欄除《社評》外，尚有《新聞小語》、《新聞解說》、不代表本報意見傾向的《議事亭》、《讀者之友》，分別以國際、國內和澳門的大事為議論對象。現任社長李成俊在紀念《澳門日報》創刊40周年的文章中說，“本報評述多著重熱點、難點，新聞背景材料充實，捕捉國際風雲變幻，透視祖國經濟建設走勢，從種種錯綜復雜的現象中，深入分析本質，尤其對海峽兩岸和平統壹，貫徹壹國兩制，言簡意賅，鞭辟入理，至於反映當地居民疾苦，維護居民合法權益，言之有理，不遺余力……
“澳聞版”除了爭取以第壹時間全面報道社會各方面的動態之外，還經常組織“特稿”、“專訪”、“雜談”、“散記”等專欄，對讀者關心的話題加以剖析、發表述評。這些欄目分別從各個不同的視角，透視出澳門五光十色的社會現狀和人文走向。文章根據不同內容，采取不同的筆調，做到了行文輕松、雅趣、確切、生動、獨異及風格多樣。