撰寫的學術著作主要有《渠道金屬網箱式流水養魚及網箱結構》、《金屬網箱式流水養魚發展與應用綜述》、《CEC/APPLE線性規劃配方設計軟件在魚飼料配方中的應用》、《日本OMRON.---200工業PC程序的編制》、《開發三峽漁業安置庫區移民》、《民營企業—21世紀中國經濟的希望》、《進壹步轉變觀念加快民營經濟的發展》等論文。
2010年6月，劉漢元與與西南財經大學能源經濟研究所所長劉建生耗時壹年聯合著述《能源革命：改變21世紀》壹書。該書由國務院發展研究室中國言實出版社出版發行，全國人大前副委員長成思危、全國人大副委員長陳昌智、全國政協副主席黃孟復等鼎力推薦，系壹本為21世紀經濟社會可持續發展提供嶄新視角和方法論的高端讀物。基於劉漢元帶領通威集團參與中國新能源發展四年多時間的執著實踐和潛心思考，和在中國能源經濟研究領域二十多年的孜孜以求，該書以物理學、經濟學、歷史學和社會政治學等跨界研究的宏觀視野和理論體系，並首次提出物理經濟學的嶄新概念且憑借這壹獨特視角，通過對全球能源問題展開從微觀到宏觀，從理論到實踐，通過對歷史與能源關系的全新探索、比較研究和量化分析，立足現實，著眼未來，全面思考，深刻闡釋，向人們系統描繪了壹場現代文明發展歷程上具有非凡意義的嶄新革命——能源革命，為減輕現代經濟加速發展給人類社會造成的環境隱患和生存危機，為解決和平發展、環境與氣候變化、能源可持續來源這三大21世紀全球根本問題，提供了壹種最獨特、最可信、最有價值、最具前瞻性甚至最根本性的答案，充分揭示了人類社會發展的根本原動力是能源與能源革命這壹主題。企業家與學術專家的強強聯合，最終形成研究了“能源革命”這壹重大命題的必備基礎，並形成了從技術、工藝、企業、產業、國家政策、經濟學、物理學、全球視野、大歷史視角的整體思考、深入細節的必備能力，從而完成了“能源革命：改變21世紀”這種重大命題的研究與破題。該書最大的嘗試就是將物理學與經濟學這兩個全然不同的體系融為壹體，並對人類文明史、現實與未來作積極探討和預測。該書更通過全面深刻的分析闡釋，全力呼籲處於世界經濟格局急劇變革中的當代中國，必須盡快搶抓大力發展新能源這壹難得的時代機遇，為中華民族的偉大復興贏得強大而持久的推動力量。