1.利用ETF基金凈值與二級市場價格之間的差價進行套利。
這是ETF基金套利的最基本方式，也是ETF基金的優勢所在。由於套利的存在，其二級市場價格不會大幅偏離其基金凈值。具體套利路徑如下:如果ETF基金凈值低於二級市場價格，投資者可以先買入壹籃子股票（如上證180指數股票組合），然後用壹籃子股票在ETF壹級市場購買ETF基金，同時以較高的市場價格在二級市場賣出ETF基金，從而實現套利；另壹方面，如果ETF基金的凈值高於二級市場價格，投資者可以反方向操作，即以較低的市場價格在二級市場買入ETF基金，然後在ETF壹級市場贖回壹籃子股票組合，同時在股票二級市場賣出股票組合以實現套利。當然，上述套利受制於二級市場的交易成本和ETF基金的申購贖回成本，只有在套利收益大於上述成本時才能操作。
第二，做空ETF基金的成份股
這種套利方法利用了ETF基金的交易規則。ETF基金全部投資於壹個指數，如上證180指數、上證50指數和深證100指數。當指數中的成份股停牌時，該股票在ETF壹級市場購買或贖回時按停牌前的價格計算。做空ETF基金的典型案例是長江電力。長江電力停牌時，上證綜指在4000點左右。停牌後，上證指數暴跌至1600點。機構普遍認為，長江電力復牌後將回補跌幅。因此，持有長江電力的投資者先買入其他179成份股構建上證180指數，然後在壹級市場購買ETF基金，在二級市場賣出ETF，從而達到以停牌前的價格賣出長江電力的目的。盡管長江電力在2009年復牌後不跌反漲，但做空長江電力的投資者還是蒙受了損失。但是，這種套利方法仍然非常實用。
第三，成為ETF基金的成份股。
同樣，這種套利方法也使用了ETF基金的交易規則。做多ETF基金的典型案例是近期深發展和中國平安的“深愛”。當中國平安宣布收購SDB股票時，兩只股票都停牌了。市場普遍預計，這兩只股票在開盤後都將大幅上漲。因此，投資者可以在二級市場上購買ETF基金（該基金投資的指數應包括中國平安和深發展股票）。例如，買入上證50指數ETF（含中國平安）和深證100指數ETF（含深發展），並在壹級市場贖回ETF基金以獲得上證50指數股票組合或深證100指數股票組合，立即在二級市場賣出其他股票，僅保留中國平安或深發展股票，並在復牌後以較高價格賣出以實現套利收益。
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