首先，三本院校的師資力量和高端人才引進與壹本院校存在根本差距。因為三本院校大多是民辦院校或獨立學院，在科研經費和財政投入上與壹本大學肯定有很大差距，師資力量相對薄弱。教師隊伍中，民辦院校博士生、教授、副教授的比例很小。國家重點學科和重點實驗室建設也無從談起。因此，三所大學的學習氛圍、創新能力和科研能力與壹所大學不可同日而語。
其次，這三所大學的生源質量與國有大學有很大差距。壹本院校的招生，無論在各省、自治區、直轄市，都是在優秀生源當中。三本院校錄取的學生素質與壹本院校錄取的學生素質差距較大，表現在學生的自律能力、獨立生活能力和學習的主動性、積極性、創新性等方面存在較大差異。
再次，學校綜合實力差距巨大，導致學生的眼界、思想境界和綜合能力差距巨大，從而影響學習氛圍和風氣。眾所周知，壹流大學不僅有壹流的學習氛圍，還有壹流的師資力量。只有優秀的大師才能培養出優秀的人才。同樣的學生，在壹所大學和三所大學不同的教育環境中，對學生的思想境界、思維能力和創新意識產生不同的影響，對學生的眼界也產生不同的影響。而這壹切因素都是成就人生最寶貴的財富。
然而，三所學校的學習氛圍並不完全相同。相當壹部分，這三所大學的學習氛圍和學生的自主學習能力比許多公立二本大學要好。比如被學生稱為“法西斯”管理的廈門工學院、沈陽工學院、武昌首義學院、文華學院、大連財經大學的學生都很優秀，管理也很苛刻嚴格。在這些院校中，每年被名牌大學錄取的研究生非常多。
綜上所述，由於客觀原因和條件的限制，三本院校與壹本院校的學風創新能力存在較大差距，但只要三本院校創新自身，強化機制，增強造血功能，引入競爭機制，完全可以強化自身功能，在雙壹流建設的大潮中重振雄風、再鑄輝煌。