1978年復校後，每年招收會計學專業本科生。1989年與上海外國語大學合作開設國際會計專業，2002年，將其納入學校中外合作本科招生計劃（現美國會計班）。1989年，上海財經大學成為全國第壹批招收財務管理專業本科生的高校，現每屆招收二個班。1994年起，與英國特許公認會計師公會（ACCA）及英國牛津布魯克斯（Oxford Brookes）大學等機構合作，開設國際會計專業ACCA方向本科班。1994年，為加快註冊會計師專門人才的培養，國家財政部在全國22所高等院校開設了註冊會計師專業方向，該院是最早設置該專業的高校之壹。從2001年開始，加拿大註冊會計師公會（CGA）與學院***同培養國際會計中外合作CGA方向本科生。
1981年，會計學科被批準為全國首批會計學博士點；1985年2月，上海財經大學創辦上海大華會計師事務所，這是我國高等院校中成立的第壹家會計師事務所，為提高我國會計師事務所的執業質量積累了豐富的實踐經驗，也為會計學專業和財務管理專業的學生提供了壹個很好的社會實踐基地；1988年會計學科被原國家教委遴選為國家級重點學科；1997年10月經財政部批準在原會計系基礎上設立會計學院；2000年9月上海財經大學會計與財務研究院被遴選為國家人文社會科學重點研究基地，這是我國高等院校中會計學和財務管理專業兩個國家級人文社會科學重點研究基地之壹。2002年會計學科再次被教育部遴選為國家級重點學科。
實驗室設備在教學和科研中發揮了重要的作用。實驗室不僅開放時間長，而且創造了完備的課程實驗條件、便捷的使用計算機和使用校園網的條件。實驗室提供的每臺機器都可以方便快速的登陸校園網絡和互聯網絡，便於學生查找所需信息資料，在教學和科研工作中發揮了重要的作用。
為了使實驗室能夠充分有效地為課程教學和學生能力培養服務，學院投入了相當壹部分的資金專門用於實驗室及實驗課程的建設。目前實驗室安裝了用友ERP系統、SPA Business One/Accapc等功能更為完善的國內外知名管理軟件、以及審計之星等審計軟件，可以為學生提供會計、審計、財務管理、會計信息系統等專業必修課程的實驗環境，學生可以在實驗室中根據任課教師設計的模擬情景和數據完成課程實驗練習、實驗和考試。
學院已在會計信息系統、財務管理決策支持系統和財務分析等課程中充分利用實驗室教學，通過實踐課程提高生的應用能力和分析問題、解決問題的能力。
為了保障實驗室的有效利用，學院已經建立了較為完整的實驗室管理制度，積極培養實驗室師資。