中文著作
《中級微觀經濟學》（主編），2008，高等教育出版社。
《為增長而競爭：中國增長的政治經濟學》（與周黎安合編），2008年，上海格致出版社和上海人民出版社。
《轉型、治理與中國私人企業的演進》，2006年，復旦大學出版社。
《讀懂中國經濟》，2006年，中國發展出版社。
《資本形成、投資效率與中國的經濟增長》，2006年，清華大學出版社。
《高級微觀經濟學》（主編），2005年，清華大學出版社。
《組織、制度和中國的經濟改革》（2004）
《資本形成、投資效率與中國的經濟增長》（2005）
《中國的工業改革與經濟增長》，2003年12月，上海人民出版社和上海三聯書店。
《書裏書外的經濟學》，上海三聯書店2003年1月版。
《高級微觀經濟學》（主編），復旦大學出版社2002年11月版。
《話說企業家精神、金融制度與制度創新》，上海人民出版社2001年版。
《走近經濟學》，北京三聯書店2001年版。
《市場的微觀結構》（譯著），中國人民大學出版社2002年10月版。
《協調博弈：互補性與宏觀經濟學》（譯著），中國人民大學出版社2001年版。
《合作團隊的經濟學：壹個文獻綜述》，上海財經大學出版社1999年版。
《比較經濟模式：關於計劃和市場的經濟分析》，復旦大學出版社1999年版。
《中國經濟改革的回顧與分析》，山西經濟出版社1998年版。
《經濟、社會與文化：張軍經濟隨筆集》，復旦大學出版社1998年版。
《我們身邊的經濟學》，(譯)，學林出版社1998年版。
《雙軌制經濟學：中國的經濟改革1978-1992》，上海三聯書店和上海人民出版社1997年版。
《微觀經濟學》(主譯)，中國人民大學出版社1997年版，2000年新版。
《中國過渡經濟導論》，立信出版社1996年版。
《特權與優惠的經濟分析》，立信出版社1995年版。
《現代公司的理論與經驗》，上海譯文出版社1994年版。
《公***選擇》(譯)，上海三聯書店1993年版。
《現代產權經濟學》，上海三聯書店1991年版。
《法和經濟學》(主譯)，上海三聯書店1991年版。
《西方宏觀經濟學導論》(譯)，復旦大學出版社1991年版。
代表性中文論文
“改革以來中國地方政府財政支出效率變化研究：1978－2005”（與陳詩壹合作），《中國社會科學》，2008年第4期。
“三十年來中國：經濟改革3與增長模式”，《社會科學戰線》，2008年第1期。
“中國地方官員為什麽要改善基礎設施？”（與王世磊合作），《經濟學季刊》，2007年1 月（第7卷第2期）。
“分權與增長：中國的故事”，《經濟學季刊》2007年10月（第7卷第1期）。
“官員的任期限制、異地交流與經濟增長”（與高遠合作），《經濟研究》，2007年第11期。
“中國為什麽擁有了良好的基礎設施？”（與高遠等合作），《經濟研究》，2007年第3期首篇。
“中國金融深化-生產率關系的再檢測：1978-2001”（與金煜合作），《經濟研究》，2005年第11期。
“中國省國際資本存量的再估計”（與吳桂英等合作），《經濟研究》，2004年第8期。
“權威、企業績效與國有企業的改革”（與王祺合作），《中國社會科學》2004年第5期。
“中國的工業改革與效率變化：方法、數據、文獻與現有的結論”（與陳詩壹等合作），《經濟學季刊》，2003年10月號。
“市場結構、成本差異與國有企業的民營化進程”（與羅長遠等合作）在《中國社會科學》第5期的首篇。
“關於中國資本存量的另壹種測度方法”（與章元合作），《經濟研究》2003年第7期。
“改革以來中國的資本形成與經濟增長：新的發現與解釋”，2002，《經濟研究》，第6期首篇。
“增長、資本形成與技術選擇：對中國經濟增長下降的解釋”，2002，《經濟學季刊》（北大中國經濟研究中心）第2卷第1期。
“關於信息產品***享的經濟模型”（與姜建強合作），2002，《經濟學季刊》（北大中國經濟研究中心）第2卷第2期。
“中國國有工業利潤率的變動模式：1980-1997，2001，《經濟研究》，第3期。
“集體所有制鄉鎮企業改制的經濟學分析”（與馮曲合作），2000，《經濟研究》，第7期。
“中國制造業利潤率的決定：來自普查的證據”（與村上直樹等合作），2000，《中國社會科學季刊》，冬季號。
“轉型國家的初始條件，改革速度和經濟增長”（與Hallagan合作），1999，《經濟研究》，第10期。
“需求，規模效應和中國國有工業的虧損：產業組織的方法”，1998，《經濟研究》，第6期。
“改革起點和改革路徑:壹個可行的模擬”(與Hallagan合作)，1996，《經濟研究》，第1期首篇。
“蘇聯的增長方式:壹個綜述”(與韓賢旺合作)，1996，《經濟研究》，第8期。
“社會主義的政府與企業:從退出角度的分析”，1994，《經濟研究》第9期。
“中央計劃經濟下的產權與制度變遷理論”，1993，《經濟研究》，第5期。
“尋求短缺的制度原因”，1991，《經濟研究》，第12期。
“產權結構、所有制和社會主義企業制度”，1989，《經濟研究》，第8期。
“改革後中國農村改革產品的供給:理論與經驗研究”，1998，《社會科學戰線》，第1期。
“過渡經濟學:我們知道什麽?”，1998，《社會科學戰線》，第5期。
“轉軌經濟中的過度進入問題--對重復建設的經濟學分析”，1998，《復旦學報》，第1期。
“改革後中國農村的非正規金融部門:溫州案例”，1997，《中國社會科學季刊(香港)》，第20卷(秋季)。
“過渡經濟學:理論的回顧與爭論”，1997，《上海經濟研究》，第4期。
“中國農村的公***產品供給:改革後的變遷”，1996，《改革》，第5期。
“中國的漸進改革為什麽成功?”，1996，《經濟學家》，第3期。
“關系:壹個初步的經濟分析”，1995，《世界經濟文匯》，第6期。
“信息費用、有限理性和計劃的約簡:對中國計劃經濟結構的壹個假說”，1992，《經濟發展研究》，第3期。
“國有企業的貨幣激勵:理論與經驗研究”，1991，《上海經濟研究》，第6期。
“關於企業制度的理論模式”，1991，《世界經濟文匯》，第4期。