南京大學是國家985、211首批建設院校，擁有9個專業碩士學位授權點、213個碩士學位授權點、23個壹級博士學位授權點、23個博士後流動站、8個壹級學科國家重點學科和13個二級學科國家重點學科。現有國家實驗室1個（籌建中），國家重點實驗室6個。學校擁有壹支高素質的師資隊伍，其中中國科學院院士29人、中國工程院院士4人、第三世界科學院院士4人、俄羅斯科學院外籍院士1人、973計劃和重大科研計劃首席科學家9人。
2.東南大學
東南大學是國家“985、211”重點大學。學校擁有5個壹流學科，3個國家重點實驗室和2個國家工程研究中心。在教育部學位中心2007-2009年全國學科評估排名中，生物醫學工程排名1，交通運輸工程排名第二，建築與藝術排名第三，土木工程排名第五。此外，電子科學與技術、儀器科學與技術、信息與通信工程、公共衛生與預防醫學、電氣工程、動力工程、工程熱物理等6個學科進入全國10強。
3.南京理工大學
南京理工大學是國家“211”重點大學、工業和信息化部直屬全國重點大學。學校擁有2個壹流學科，2個學科國家重點學科4個，省部級重點學科20個，省部級重點品牌和特色專業33個。1個國家重點實驗室，2個國家工程中心，12個壹級學科博士後流動站，39個博士點覆蓋16個壹級學科，16個碩士點覆蓋36個壹級學科。學校有權對教授的資格進行整體審批，並可以通過自我評估的方式增加博士生導師。
4.南京航空航天大學
學校是工業和信息化部直屬的全國“211”重點大學。其中國家重點實驗室1個，部級重點實驗室12個，部級開放實驗室12個。現有壹級學科博士學位授權點10個，二級學科博士學位授權點52個，碩士學位授權點127個，博士後流動站12個。9個2個學科為國家重點學科，8個學科為國防科工委重點學科，8個學科為國防科工委重點學科；有2個國家級工科基礎課教學基地和2個國家級實驗教學示範中心。它是中國52所設立研究生院的大學之壹。
5.南京農業大學
南京農業大學是“211工程”國家重點建設大學。有13個國家重點學科和23個省（部）重點學科。建立了作物遺傳與種質創新國家重點實驗室、國家大豆改良中心、34個省級研究所（中心和實驗室），以及100多個校級研究所、研究室和工程技術研究中心。現有博士後流動站13個，博士學位壹級學科授權點12個，碩士學位壹級學科授權點17個，博士學科65個，碩士學科106個，本科專業57個，第二學士學位專業1個，專業學位授予權5個。
6.河海大學
河海大學是國家“211”重點工科院校，擁有1個國家重點實驗室和1個國家工程研究中心。現有博士點38個，碩士點124個，工程碩士專業學位領域18個，壹流學科1個，2個學科國家重點學科7個，博士後流動站7個。其中，水利工程和土木工程的綜合實力在國內處於領先地位，特別是水利工程的綜合實力在國內處於壹流地位。在世界水利水電工程方面，僅次於荷蘭代爾夫特理工大學，處於世界領先水平。
7.南京師範大學
南京大學是國家“211工程”重點建設的江蘇省重點大學。目前擁有國家重點學科6個、國家重點學科（培育）3個、江蘇省國家重點學科培育建設點6個、江蘇省壹流學科7個、江蘇省重點學科21個、江蘇省重點學科培育建設點5個。現有博士學位授權壹級學科7個，二級學科博士學位授權專業82個，碩士學位授權學科21個，二級學科碩士學位授權專業168個，專業碩士學位授權點4個，高校教師碩士學位授權點1個。
8.中國藥科大學
中國藥科大學是教育部直屬的國家“211工程”重點建設大學，辦學歷史悠久、特色鮮明、學風優良，在藥學領域享有盛譽。是中國唯壹壹所部屬專業藥學院，也是世界上規模最大的專業藥科大學。藥學壹級學科為國家壹級重點學科，涵蓋藥物化學、生藥學、藥學、藥物分析、藥理學、微生物學、生化藥學6個學科門類。在2008年教育部學科評估中，我校壹流學科藥學排名全國第壹，中藥學排名全國第三。
9.南京工業大學
南京工業大學是壹所以化學工程為主的省屬重點大學。其中國家重點實驗室1個，國家工程研究中心1個，國家技術推廣中心1個。省部級工程研究中心9個；國家重點學科1人，中國工程院院士3人，國務院學位委員會學科評議組成員1人，國家“973”計劃首席科學家3人，軍隊“973”計劃首席科學家1人，國家“863”計劃專家2人。我校擁有國家“973計劃”項目6項，軍隊“973計劃”項目1項，在江蘇地方高校中排名第壹。
南京郵電大學10
南京郵電大學是工業和信息化部與江蘇省人民政府共建高校。現有博士後流動站1個，博士點6個，碩士點19個，本科點38個；建立了國家、省、高校重點學科建設體系，信號與信息處理為國家重點學科（培育）、省級重點學科4個、原信息產業部重點學科6個。有通信工程等國家級特色專業建設點4個，省級品牌特色專業和建設點10個。其中，中國通信學院學術工作委員會、通信理論與信號處理委員會和多媒體通信委員會均隸屬於我校。
南京林業大學11
南京林業大學是壹所中央與地方共建高校。林楠大廈現有博士後流動站5個，壹級學科博士點3個，博士點和博士學位授權點30個，壹級學科碩士點2個，碩士點和碩士學位授權點54個，專業學位授權點12個。林業工程國家重點學科1，包括生態學、林木遺傳育種、林產化學加工工程、木材科學與技術、森林保護等。
南京信息工程大學12
南京信息工程大學前身是“中國氣象人才搖籃”，是國家氣象局直屬院校，江蘇省“十壹五”重點建設高校。擁有22個國家級和省級重點學科，14個博士學位授予點和24個碩士學位授予點。許多校友已成為國內外著名科學家和相關部門領導，包括中國科學院、中國工程院、加拿大皇家科學院院士、中央部委領導和世界氣象組織高級官員。全國氣象領域70%的技術骨幹來自這所學校。
13南京財經大學
南京財經大學是江蘇省重點全日制本科高等學校。擁有應用經濟學壹級學科碩士點1個，二級學科碩士點22個，MBA等專業學位學科1個。學校擁有國家級人才培養模式創新實驗區2個、國家級優秀教學團隊1個、國家級實驗教學示範中心1個。行業南京財經大學經濟學、統計學等2個優秀學科位列江蘇高校梯隊。食品科學與工程、統計學2個國家級壹流特色專業建設點。
南京醫科大學14
南京醫科大學是我國最早開展研究生教育的高等院校之壹。學校被列為全國首批六年制醫學院校。1981年，學校獲批為全國首批博士、碩士學位授予單位。1個國家重點實驗室培育基地、1個部級重點實驗室、2個省級重點實驗室、7個江蘇省重點實驗室和工程研究中心。
15南京審計大學
南京審計大學與國家審計署同時誕生，與中國審計事業同步發展。審計和金融是教育部的特色專業。2007年，他們以“優秀”的成績通過了教育部本科教學工作水平評估。2002年被ACCA總部授權為“全球推薦培訓機構”。2007年，我校被IIA（國際內部審計師協會）認定為IAEP（內部審計教育合作夥伴）在中國唯壹的“合作級”機構，並成為IIA在全球認可的39所機構之壹。
南京工程學院16
南京工程學院是省屬本科院校，全國高等學校教學研究會第二屆理事會副會長、全國高等學校教學研究會應用型本科高校專委會主任委員。國家級特色專業建設點1個，省級特色專業品牌4個，其中江蘇省“333工程”培養18人，江蘇省“青藍工程”培養中青年學科帶頭人8人，教育部高等學校專業教學指導委員會委員3人，享受國務院特殊津貼專家14人，江蘇省有突出貢獻中青年專家2人。
17，南京曉莊學院
南京曉莊學院，壹所公辦本科院校，坐落在風景秀麗、人文濃郁、有“六朝古都”美譽的南京。現有省級重點建設學科1個，省級實驗教學示範中心1個，建設點2個，省級特色專業1個，國家級和省級特色專業建設點1個，其中現當代文學為省級重點建設學科，小學教育專業為國家級特色專業建設點。
金陵科技學院18
金陵科技學院是南京市屬高校。2005年被教育部正式批準為由金陵職業學院和南京農學院合並組建的本科院校。專業教師中，雙師型教師占1/2。又有壹批教師入選省“青藍工程”“333工程”和國家、省有突出貢獻中青年專家。
19，南京藝術學院
南京藝術學院是江蘇省唯壹的綜合性高等藝術院校，也是中國最早的獨立院校並延續至今。擁有藝術學壹級學科博士、碩士學位授予權，藝術學壹級學科博士後科研流動站1個，美術學、音樂學、藝術學、設計藝術、電影、數字媒體藝術與文化產業2個學科博士學位授予點7個，美術學、音樂學、設計藝術、美術學、電影、數字媒體藝術與文化產業碩士學位授予點7個。
20.南京體育學院
南京體育學院是江蘇省最大的競技體育訓練基地，包括乒乓球、羽毛球、網球、籃球、排球、田徑、舉重、體操、藝術體操、武術、跳躍等項目。南京體育學院是江蘇省唯壹壹所專門培養各類體育人才的高等體育院校，設有體育教育與訓練、體育人文與社會學、運動人體科學3個碩士點。