1.考試試題不同
金融碩士：思想政治理論 英語壹或英語二 數學三（統考）或396經濟類聯考綜合 金融學綜合
金融學碩士：思想政治理論 英語壹 數學三（統考） 經濟學
目前專碩考試的趨勢是統壹考英語二和經濟學聯考綜合：英語二較英語壹考察的英語詞匯量更少、分析能力要求更低、難度相對小；經濟類聯考綜合考察數學知識簡單，基本為初高中內容，添加邏輯能力的考察，整體難度小於數三。
2.培養方式不同
金融碩士：應用型碩士 學制2年 自費
金融學碩士：學術型碩士 學制壹般3年 公費或自費或委培
3.課程設置不同
在課程設置上金融學碩士作為學歷教育，重點是基礎教育、素質教育和專業教育，偏重理論知識的掌握和學習；
金融碩士作為職業教育，則更多偏重於實務，學習的目的是為了解決實際工作中的問題。
例如，金融學碩士第壹年會著重學習高級微觀、高級宏觀、中級金融理論、金融思想史；金融碩士則不要求，更側重於金融工具、計量經濟學、統計學、證券投資的學習。
4.導師制度不同
按照教育部指導規劃，專業碩士采取雙導師制度，即社會導師和校內導師雙導師。
5.讀博要求不同
專業碩士不能直博，即不能直接保送讀博，但仍可以考博；學術型碩士目前改革試點院校提供較少比例的直博名額，入學篩選後確定。
6.總結——金融專碩代表未來方向
隨著碩士招生體制的改革不斷推進，專碩已經開始於學碩並駕齊驅，後者註重研究型人才培養，前者註重應用培養，各有所長；從中央財經、人大10級會計專碩的就業趨勢來看，完全不遜於學碩。金融專業本身就具有實踐性強的特點，兩年的全日職專業碩士(學碩壹般三年)的培養方式更能滿足就業的需要。長期以來社會上壹直存在大學教育與社會實踐脫節的批評，專業碩士的出臺有利於改善這種狀況。
文碩教育專家提示：
(1)目前專碩考試的趨勢是統壹考英語二和經濟學聯考綜合：英語二較英語壹考察的英語詞匯量更少、分析能力要求更低、難度相對小；經濟類聯考綜合考察數學知識簡單，基本為初高中內容，添加邏輯能力的考察，整體難度小於數三。
(2)金融專業碩士初試改革趨勢——弱化對英語和數學要求(英語二和經濟學聯考綜合)+教學上側重實踐(壹般為兩年學習時間、雙導師制、要求實習)。