秦、隋時，莒南縣劃入瑯琊郡莒縣，唐代屬河南莒縣，明代屬青州莒州，清代屬益州莒州。民國三十年（1941年）莒南縣抗日民主政府成立，因分析在莒南縣南部設縣而得名。截至2021年3月，莒南縣轄1個街道和15個鎮，共有266個行政村和741個自然村。。
西周時期，莒屬於郭襄。
東周時期，項國被莒國所滅，莒南地區屬於莒國。
秦朝時期，它與莒國壹起被分配到莒縣、瑯琊縣。
西漢時屬高祥郡，屬敘州刺史瑯琊郡。
東漢時，縣改為州，隸屬於莒縣、瑯琊州、徐州刺史部。
曹魏時，莒南中部和東部屬於青州市莒縣、城陽縣，西部沭河兩岸狹長地帶（即王家溝鄉、石蓮子鄉、道口鄉、劉家莊鄉、芳官鄉、相溝鄉和板泉鎮）屬於徐州瑯琊州開陽（今臨沂市）。
西晉時期，莒南地區隸屬於徐州東關縣莒縣，沭河以西地區隸屬於徐州瑯琊州開陽縣。東晉十六國時期，莒南地區按時間先後屬於後趙、顏倩、前秦、後燕、靳東和南燕，都屬於東關縣，南燕獨立時該縣被分縣。莒南地區屬於東莞縣莒縣。
劉，莒南縣人，原屬徐州市莒縣、東關縣。明帝失去兩淮（465-471）後，莒南隸屬於魏源，隸屬於莒縣、東關縣、南青州。
在高旗的時候，莒屬於懷仁縣，唐毅縣，青州南部。禹文州屬唐毅縣懷仁縣、莒州。
隋，益州（瑯琊縣）莒縣人。
在唐代，它屬於河南省道米州莒縣。
五代時期，沿唐制，仍屬河南密州莒縣。
北宋時，屬JD.COM東路密州莒縣。
晉時在山東東路莒州莒縣。
元代屬山東省益都路莒州縣莒縣。