六部尚書的六部其實是平行的沒有高低之分，但職責和負責的事務不同也會在不同的時期有不同的威望。
六部機構簡介
吏部：吏部為管理文職官員的機關，掌品秩銓選之制，考課黜陟之方,封授策賞之典,定籍終制之法。吏部下設四司，明清為文選清吏司、驗封司、稽勛司和考功司。
文選清吏司掌考文職之品級及開列、考授、揀選、升調、辦理月選。驗封司掌封爵、世職、恩蔭、難蔭、請封、捐封等事務。稽勛司掌文職官員守制、終養、辦理官員之出繼、入籍、復名復姓等事。考功司掌文職官之處分及議敘，辦理京察、大計。
戶部：戶部掌全國疆土、田地、戶籍、賦稅、俸餉及壹切財政事宜。其內部辦理政務按地區分工而設司,明十三司:河南、山東、山西、陜西、浙江、江西、湖廣、廣東、廣西、四川、福建、雲南、貴州。清增江南司,為十四司。
各司除掌核本省錢糧外，亦兼管其他衙門的部分庶務，職責多有交叉。除以上各司外，清還設有掌管八旗事務的八旗俸餉處及現審處。隸於戶部的機構有:掌鑄錢的錢法堂及寶泉局;掌庫藏的戶部三庫;掌倉儲及漕務的倉場衙門。
禮部：禮部掌典禮事務與學校、科舉之事。考吉、嘉、軍、賓、兇五禮之用;管理全國學校事務及科舉考試及藩屬和外國之往來事。禮部下設四司，明清皆為:儀制清吏司，掌嘉禮、軍禮及管理學務、科舉考試事;祠祭清吏司，掌吉禮、兇禮事務;主客清吏司，掌賓禮及接待外賓事務;精膳清吏司，掌筵饗廩餼牲牢事務。
四司之外，清設有鑄印局，掌鑄造皇帝寶印及內外官員印信。會同四譯館，掌接待各藩屬、外國貢使及翻譯等事。
兵部：明職掌全國軍衛、武官選授、簡練之政令。清職掌全國綠營兵籍及武職官員的機構。職掌內外武職官員的除授、封蔭之典，乘載、郵傳之制，甄核、簡練之方，士籍、軍實之數。
兵部下設四司:武選清吏司，考核武職官員的品級與選補、升調、承襲、封贈諸事，並管理土司;車駕清吏司，掌全國馬政及驛傳等事;職方清吏司，掌武職官員的敘功、核過、撫恤、軍旅之簡閱、考察、巡防等事，並管理關禁與海禁;武庫清吏司，掌全國之兵籍、軍器並武科考試之事。此外，清設稽俸廳，掌稽察武職官俸;會同館，管理京師驛傳事務;捷報處，掌遞送文書。
刑部：刑部為主管全國刑罰政令及審核刑名的機構，與督察院管稽察、大理寺掌重大案件的最後審理和復核，***為"三法司制"。刑部的具體職掌是:審定各種法律，復核各地送部的刑名案件，會同九卿審理"監候"的死刑、案件以及直接審理京畿地區的待罪以上案件。刑部的內部組織機構的設置是按省設司,明為十三司,名稱與戶部諸司同。
清增加直隸、奉天、江蘇、安徽四司，為十七司。清刑部各司除分核本省刑名外，職掌他省及衙門的部分文書收發和某些日常政務。此外，清設督捕司，掌督捕旗人逃亡事;秋審處，掌核秋審、朝審各案;減等處,掌匯核各省及現審各案之遇赦減等事;提牢廳,掌管獄卒，稽察南北所監獄的罪犯，發放囚衣、囚糧及藥物等;贓罰庫，掌收放現審案內贓款及沒收各物件，並保管本部現銀及堂印;贖罰處，掌罰罪事;律例館，掌修訂法律。
工部：工部為管理全國工程事務的機關。職掌土木興建之制，器物利用之式，渠堰疏降之法，陵寢供億之典。凡全國之土木、水利工程，機器制造工程(包括軍器、軍火、軍用器物等)，礦冶、紡織等官辦工業無不綜理，並主管壹部分金融貨幣和統壹度量衡。
明清工部下設四司，營繕清吏司，掌宮室官衙營造修繕;虞衡清吏司，掌制造、收發各種官用器物，主管度量衡及鑄錢;都水清吏司，掌估銷工程費用，主管制造詔冊、官書等事;屯田清吏司，掌陵寢修繕及核銷費用，支領物料及部分稅收。除四司外，清設有制造庫，掌制造皇帝車駕、冊箱、寶箱、儀仗、祭器等;節慎庫，掌收發經費款項;料估所，掌估工料之數及稽核、供銷京城各壇廟、宮殿、城垣、各部院衙署等工程。
：古今對比
吏部:中央組織部、人力資源和社會保障部;
戶部:財政部、民政部;
禮部:外交部、教育部、文化部;
兵部:國防部;
刑部:司法部、公安部;
工部:住房和城鄉建設部、水利部、工信部;
禦史臺(都察院):最高人民檢察院、監察部、中紀委;
大理寺:最高人民法院。