對於申請馬來西亞科技大學的留學生來說，在選擇專業的時候，也會更多的考慮馬來西亞科技大學的專業。馬來西亞科技大學作為壹所公立高等學府，在經濟、藝術、科學、工程和醫學等領域都有著突出的學術水準，因此其藥學和藥理學、建築和建成環境、化學工程、語言和文學等專業頗受歡迎。
藥學和藥理學專業
馬來西亞科技大學藥學院提供藥物化學，制藥技術，藥理學，生理學，臨床藥學和社會與管理藥學。
建築與建成環境專業
馬來西亞科技大學住宅、建築與規劃學院是馬來西亞科技大學的熱門學院之壹。開設建築學、室內設計、建築勘測、建築技術、施工管理、城市與區域規劃、工料測量七個本科專業，並獲得多個專業學科認證，如:馬來西亞建築師學會、馬來西亞建築師理事會、皇家測量師學會、皇家特許測量師學會、亞太工料測量師協會、馬來西亞規劃師學會。
此外，住宅、建築與規劃學院還開設了碩士和博士學位的課程和研究，研究方向廣泛，涵蓋建築技術、城市規劃、項目管理、建築學、風景園林、室內設計、住宅和數量測量等八個領域。
化學工程
馬來西亞科技大學化學科學學院是馬來西亞最大的化學學院之壹。遵循自由的多學科研究體系，提供從本科到博士的各種化學專業課程，涵蓋有機化學、物理化學、無機化學、工業化學、分析化學等專業方向。
語言文學專業
馬來西亞科技大學人文與文科學院，馬來西亞領先的人文學院之壹。人文學院作為人文學科的中心，學術領域廣泛，涵蓋哲學、文明、宗教、語言、文學、歷史、地理、翻譯等。人文學院作為學術中心，開設了文學、英語語言文學研究、翻譯與口譯三個文學學士課程。
媒體研究專業
馬來西亞科學大學傳播學院是馬來西亞媒體研究的先驅。傳播學院提供從學士到博士的多種課程。其專業領域包括傳播學、新聞學、公***關系學、廣告學、電影與廣播、傳媒與文化研究、人際傳播等學科。除了專業教學，學校還為學生提供與媒體的社會、文化、政治和歷史方面相關的廣泛知識。