先說本科院校吧，就我個人知道的有新疆大學、新疆師範大學、新疆財經大學、新疆醫科大學、新疆農業大學、塔裏木大學、石河子大學、喀什大學、伊犁師範學院、昌吉學院、新疆藝術學院。
專科類院校有烏魯木齊職業大學、新疆職業大學、新疆輕工職業技術學院、新疆石河子職業技術學院、新疆天山職業技術學院、新疆體育職業技術學院、新疆交通職業技術學院、新疆兵團警官高等專科學校等院校。
在這裏簡單給您介紹壹下新疆大學，新疆大學是全國重點大學，是國家“211工程”建設高校、國家西部大開發重點建設高校、國家教育部與新疆維吾爾自治區人民政府***建高校
還要提到的就是石河子大學，它不僅是211重點工程綜合類大學更是在新疆數壹數二的大學，它的本部是在石河子，隸屬於新疆生產建設兵團。與石河子大學並列的是新疆大學，同樣是211類大學，本部是在烏魯木齊，隸屬於新疆維吾爾自治區教育廳。新疆財經大學，本部在新疆首府烏魯木齊，屬於財經類學校。新疆醫科大學，坐落於新疆烏魯木齊市風景秀麗的鯉魚山下，入選"卓越醫生教育培養計劃"。伊犁師範學院曾先後更名為阿合買提江專科學校、伊犁師範學校。喀什大學是壹所多民族、多學科、多形式的綜合性、應用型的現代化大學;是新疆南疆唯壹的壹所高等師範院校。新疆師範大學屬性為中西部高校基礎能力建設工程類院校。 昌吉學院屬於師範類院校。是區屬普通高等學校，隸屬於新疆維吾爾自治區教育廳。