1、在科技金融領域的創新性研究成果。
在國內首次將科技與金融相結合的課題確定為壹個獨立的、完整的研究範疇，並把科技金融界定為金融、數學、法律、公***管理等學科的交叉科學，以企業成長生命周期理論為基礎，針對高新技術企業與企業種子期、初創期、擴張期、成熟期不同發展階段的風險特征差異，在國內率先全面地開展了財政科技投入、創業風險投資、科技貸款、科技資本市場以及科技保險等金融工具和金融機制的系統性研究。主要代表性文章有：發表在國外期刊的“Public Venture Capital and Its Private Strategy”、“Public Venture Capital : An Comparison between China and United States”以及發表在《數量經濟與技術經濟》的“基於實物期權理論的風險投資項目價值評估模型”、發表在《經濟學家》的“風險投資的退出績效研究：IPO與M&A的比較”、發表在《財經科學》的“歐洲風險資本的退出機制研究”，並且被多次轉載。被列入2008年國家科技出版計劃，即將由科學出版社出版的《科技金融》是我國第壹部完整系統研究科技金融問題的專著。
除理論研究外，在科技金融方面的許多政策研究成果同樣受到了國家科技部和四川省的高度重視。趙昌文教授作為負責人起草了“四川省人民政府關於促進高新技術產業發展的金融政策與服務的若幹意見”，這個意見已經以省委、省政府的文件正式下發。因為在科技金融領域豐富的研究成果，國家科技部依托四川大學設立了全國第壹家專門的科技金融研究機構“中國科技金融研究中心”，“科技金融與數理金融實驗室”被評為四川省重點實驗室，趙昌文教授擔任中心和實驗室主任。科技部黨組書記李學勇副部長、四川省人民政府蔣巨峰省長親自為中心和實驗室揭牌。
2．在公司控制權、公司治理和購並重組方面重要的學術成果。
趙昌文教授的專著《殼資源研究—中國上市公司並購理論與案例》研究了上市公司“殼資源”的若幹基本理論、殼資源與購並重組、殼資源的利用、買殼上市的法律監管、“殼”的價值分析與定價以及中國上市公司買殼上市的總體特征和績效等問題。2001年4月該書出版後，在國內金融證券理論與實務界引起了極大關註，《光明日報》、《管理世界》、《經濟學家》等刊物為此發表了書評，著名管理學家、中國人民大學鄧榮霖教授稱“此書是迄今為止我國學術界全面、系統和深入地研究殼資源問題的壹部專著，是研究中國上市公司並購的壹項新成果”；深圳發展銀行、海通證券等機構將此書推薦為高層管理人員的必讀書；“人民網”學術理論欄轉載了發表在《光明日報》上的書評。本書獲2002年四川省哲學社會科學優秀成果三等獎。
關於“公司控制權、公司治理及其相關問題”研究的代表性文章有：發表在《中國工業經濟》上的“中國上市公司控制權私有收益及實證研究”、“資本市場對公司治理的作用機理及若幹實證檢驗”、“國有企業產權重組：幾個重要理論問題的辨析”，發表在《經濟學家》中的“創新與經營重建——兼論美日企業經營重建活動及其對中國企業的啟示”以及發表在《管理世界》上的“中國上市公司的有效控制權及實證研究”，這些文章曾被多次轉載。
3．關於西部發展問題的重要研究成果。
由於地處西部的特殊情感，趙昌文對西部發展問題的研究有很多成果，並且產生了較大的影響。特別是發表在《人民日報》（海外版）上的專訪文章---“西部開發應有創新意識”和《光明日報》理論版上的專訪文章—“西部開發中政策支持空間有多大”被數十家研究機構的網站轉載，如“中國西部開發網”、“人民網”、“中國留學人才信息網”等。2003年12月，經過趙昌文教授的努力，發起成立了“中國西部開發研究聯合體”（Consortium for West-China Development Studies），主要發起者有美國的哥倫比亞大學、密西根大學等12所國外機構和包括四川大學在內的中國西部主要的大學，並聘請哥倫比亞大學傑弗.薩克斯（Jeff Sachs）教授擔任外方顧問委員會主任，聘請國務院發展研究中心吳敬璉教授擔任中方顧問委員會主任。“中國西部開發研究聯合體”設國內秘書處和海外秘書處，國內秘書處具體負責國內各單位之間的協調聯系和聯合體的日常工作，掛靠在四川大學,趙昌文教授擔任秘書長，海外秘書處主要負責國外各成員單位之間的聯系與協調工作，掛靠在美國密西根大學中國信息研究中心,由胡永泰教授任秘書長, 鮑曙明博士任副秘書長。“中國西部開發研究聯合體”已經開始了多個具體項目的國際合作研究，並且每年召開壹次年會。第壹次會議（2004年年會）於2004年6月在四川成都舉行；第二次會議（2005年年會）於2005年6月在寧夏銀川舉行；第三次會議（2006年年會）於2006年8月在四川成都舉行；第四次會議（2007年年會）於2007年7月在貴州貴陽舉行；第五次會議（2008年年會）於2008年7月在陜西西安舉行。第六次會議2009年7月將在甘肅蘭州舉行，由蘭州大學承辦。
4．創辦《中國金融學》雜誌。
由趙昌文教授發起並擔任主編的雜誌《中國金融學》（China Journal of Finance），聘請了包括世界銀行、亞洲開發銀行、耶魯大學、牛津大學、MIT、倫敦經濟學院、密西根大學、北京大學、清華大學等國際組織和國內外壹流大學的知名學者作為學術委員，提供高水平的論文並參與審稿。創刊5年來，已經成為國內外研究金融問題的教授、研究人員發表研究成果的重要陣地，成為國內外華人金融學界高度認可和接受的學術刊物。已發表的文章中大多是運用規範的研究方法對中國金融現象與問題進行研究，也有少數對其它國家壹些金融問題的研究或者是與中國的比較研究。許多國際知名的學者如前世界銀行副行長、高級經濟學家、2000年諾貝爾經濟學獎得主、美國哥倫比亞大學約瑟夫.斯蒂格利茨教授，著名經濟學家、1996年諾貝爾經濟學獎得主、英國劍橋大學詹姆斯·莫裏斯教授，美國前金融學會主席、美國賓夕法尼亞大學Franklin Allen教授等均為《中國金融學》提供過論文。2007年，《中國金融學》被評為CSSCI來源期刊，為金融類期刊第壹名。