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張燕簡介

職務:計算系統生物學教研室主任

理學博士。2000年赴日本深造,參與日本文部科學省多個項目,2003年獲得日本新潟大學碩士學位,2006年獲得新潟大學博士學位。同年被聘為哈爾濱醫科大學生物信息與技術學院教授。他多年來壹直在生物信息學和計算表觀遺傳學領域從事教學和科研工作,並取得了卓越的成果。張燕教授領導的計算表觀遺傳學研究組致力於表觀遺傳學領域高通數據挖掘的算法和軟件開發,以及可視化網絡平臺和數據庫的建設。研究方向涉及遺傳和表觀遺傳元件的協同調控、構建表觀遺傳網絡探索表觀遺傳修飾在人類重大疾病發生發展中的作用以及生物信息學在癌癥表觀遺傳學和幹細胞表觀遺傳學結合功能基因組學中的應用。開發了軟件和數據庫平臺,如QDMR、人類組蛋白修飾數據庫HHMD、功能性CpG島預測CpG_MI、乳腺癌高甲基化基因的識別、全基因組甲基化位點的預測和分析、發現組蛋白修飾組合模式的方法、繪制酵母基因組核小體動態圖和印跡基因的預測。在SCI和EI檢索期刊及核心期刊發表論文20余篇,SCI收錄論文9篇。其中,篩選差異甲基化區域的方法、在基因組範圍內檢測功能性CpG島的方法和第壹個開發的人類組蛋白修飾數據庫QDMR這三項成果分別於2010年和2011年發表在《核酸研究》(sci if: 7.477)上。該研究小組壹直處於計算表觀遺傳學和表觀基因組學領域的前沿。目前主持國家自然科學基金面上項目1項,省、市、部項目5項,並以項目骨幹參與其中壹項預973項目。作為編委參與編寫衛生部八年規劃教材《生物信息學》。現任黑龍江省生物醫學工程學會理事。