從65438年到0952年，教育部根據“重點培養工業建設和教師，發展專門學院，整頓和加強綜合大學”的政策，開始了大規模的院系調整。
在江西，從65438年到0952年，南昌大學農學院首次分離，江西農學院獨立設置，合並為南昌農學院和江西獸醫學院，並遷至南昌縣李安堂。同年，南昌大學礦冶工程系、農業工程系、水利工程系分別並入中南礦冶學院（現中南大學）、華中農學院（現華中農業大學）、武漢水利電力學院（現武漢大學）。
1952年底，中南教育部在武漢召開全區高校院系調整會議。南昌大學由黨委書記、秘書長魏東明帶隊，副校長王秀才、總經理戴、副教務長顧繼光和時任會計系主任的我陪同。會議由中南教育部副部長徐懋庸主持，中南局宣傳部部長趙銥民作了政治報告，重點闡述了過渡時期的總路線。接著討論院系調整方案，提出取消湖南、廣西、南昌三大學校名稱，在湖南、廣西、江西三省設立獨立師範學院。
這次會議後，南昌大學進入緊張的院系調整階段，成立了中南大學院系調整委員會南昌分會，成員包括呂良、劉幹才、魏東明等14人。根據調整方案，南昌大學工程學院機械工程系和電氣工程系合並為新成立的華中工學院（現華中科技大學）；土木工程系並入新成立的中南土木建築學院（現湖南大學）；化工系並入華南工學院（現華南理工大學）；文理學院的物理系、化學系，文法學院的文史系、俄語系並入武漢大學；數學系和生物系並入中山大學；經濟系並入新成立的中南財經政法大學（現中南財經政法大學）；師範教育部教育學部與教育生物學部合並為湖南師範大學（現湖南師範大學）；歷史地理地理組並入華南師範大學（現華南師範大學）。與此同時，在專門體育系和師範系體育系的基礎上成立了中南體育學院，並在南昌大學原址臨時組建。1955遷至武漢。院系調整期間，邵世平省長請示中央批準。壹是江西師範學院改為江西師範學院，二是保留生物系。
第壹任校長、著名生物學家胡先蘇先生。
1953 11、江西師範大學成立。建校時有語文、歷史、數學、物理、化學、生物、藝術7個專業，從1954到1956，除文科外，所有學科均已發展為院系，招收四年制本科生。1958年，江西工學院、江西大學成立；1962年江西師範學院生物系並入江西大學；1985年，江西理工學院更名為江西理工大學；1993年，江西大學和江西理工大學合並組建新南昌大學。1997年，南昌大學被正式列為國家“211”重點建設大學。2005年，南昌大學與江西醫學院正式合並組建新南昌大學，學校進入了壹個全新的發展階段。
◆南昌大學歷史沿革時間概要:
●1940，國立中正大學生物系，由著名植物學家胡先蘇創建。
●1949，中正大學更名為國立南昌大學。
●1952-1953、全國高校院系調整，南昌大學原建制撤銷，部分學科並入其他院校，其中生物系參與組建江西師範大學。
●1958年，江西省成立江西大學、江西工學院，原南昌大學生物系並入江西大學。
●1965年，江西大學和江西理工學院都初具規模。江西大學有7個系，12個專業和瑞金分校。江西理工學院有4個系9個專業。
●1969年江西大學數學系、物理系、化學系並入江西理工學院，更名為江西科技大學；江西大學中文系、政治宗教系並入江西師範大學，更名為江西井岡山大學。
●1972撤銷江西理工大學、江西井岡山大學，恢復江西大學、江西理工學院原建制。
●1985，江西理工學院更名為江西理工大學；江西大學與江西共青農墾農場聯合成立江西大學共青學院。
●1993年，江西大學與江西理工大學成立南昌大學，同年成為江西省第壹個博士學位授予單位。
●1997、南昌大學在全國地方高校中率先通過國家“211工程”建設批復，成為國家重點建設項目，被列為“九五”期間首批投資建設的高校之壹。
●2002年，周文斌出任南昌大學校長。65438年2月29日，南昌大學前湖校區奠基。
●2004年，江西省人民政府與教育部簽訂協議，南昌大學實行省部共建。
●2005年，南昌大學與原江西醫學院合並組建新南昌大學。
●2007年，鄭克強出任南昌大學黨委書記。