2010年8月30日央行超級網銀正式上線，首批通過測試的銀行，可實現自身網銀與央行系統的互聯，而在同批通過測試的各家銀行之間，可實現跨行支付實時到帳、壹站式管理所有賬戶等功能。
“超級網銀”， 能為個人和單位用戶提供跨行實時的資金匯劃、跨行賬戶和賬務查詢，以及當下支付系統所無法實現的跨行扣款、第三方支付、第三方預授權等業務功能，為商業銀行在電子商務、跨行資金管理等方面為客戶提供創新服務奠定有力基礎。
小額支付系統貸記業務金額上限為2萬元，網銀互聯系統的金額上限初定為5萬元，5萬元以上的支付業務要使用大額支付系統。
“超級網銀”在開發之初的功能定位主要面向商業銀行的集團客戶，部分功能醞釀向個人客戶開放，屆時客戶可與銀行簽訂協議，確定授權，開通實時跨行轉賬以及跨行賬戶查詢功能。 跨行支付的實時到賬是二代支付系統的重要功能。
從網銀支付的處理情況來看，當收、付款人雙方均在同壹銀行開戶時，資金可實時入賬，並將資金入賬情況實時反饋客戶；當收、付款人雙方不在同壹銀行開戶時，支付指令需經過付款人開戶銀行網銀支付平臺、付款人開戶銀行行內業務系統、人民銀行跨行支付系統、收款人開戶銀行行內業務系統等多個系統的處理，涉及支付指令在多個節點、多個系統間的轉換，有些環節還需業務人員進行手工幹預。
為提高跨行網銀支付的清算效率，央行將在推出的第二代支付系統中新建了網上支付跨行清算系統，使各商業銀行網銀系統互聯互通，而跨行轉賬、支付等業務即可實現實時到帳。
此外，該清算系統提供了賬戶信息的跨行查詢功能，客戶在與開戶銀行簽訂賬戶信息查詢協議後，可以通過登錄壹家銀行的網銀系統查看開在其他銀行的賬戶信息，不過據前述股份制銀行電子銀行部人士介紹，還只能查詢活期賬戶，對於其它的理財產品等信息，該系統尚難支持。 與之前媒體報道的禁止支付寶等分金融支付機構接入該清算系統不同，根據網易財經拿到的壹份資料顯示，央行支持“經其批準獲得支付業務許可證的非金融支付服務組織的接入，實現網上支付等電子支付業務的跨行清算的高效處理”。央行稱，網上支付跨行清算系統為經央行批準獲得支付業務許可證的非金融支付服務組織提供接入渠道，支持非金融支付服務組織通過靈活多樣的方式為社會提供支付服務，能夠更好地滿足公眾居家支付需求，也有利於促進電子商務的發展以及支付服務市場的規範化管理。
包括支付寶這樣的非金融支付機構的運行模式為，依托在多家合作銀行分別開立結算賬戶，代不同銀行的客戶完成跨行支付，經營成本較高，客戶範圍也受到限制。而當該類支付服務組織也被納入系統之後，客戶只需在任壹家銀行開立賬戶並開通網銀支付功能，即可通過非金融支付服務組織發起支付業務。
央行曾於2010年6月發布《非金融機構支付服務管理辦法》（下稱“辦法”），指出支付機構依法接受央行的監督管理。辦法將於2010年9月1日起正式實施，實施前已經從事支付業務的非金融機構，應當在辦法實施之日起1年內（即2011年9月1日前）申請取得《支付業務許可證》。市場分析人士認為，央行出臺《辦法》最重要的意義是認可了非金融支付機構的行業地位，並將其納入央行的監管範圍。
央行表示，由於第三方機構的客戶可以是各商業銀行的網銀用戶，如仍通過現有方式向付款人收費，則第三方機構應在所有銀行開設賬戶，操作成本很高；如由第三方機構直接向付款人收取，處理手續非常復雜，客戶體驗也比較差。為支持第三方機構的業務發展，網上支付跨行清算系統應支持第三方機構向付款人收取手續費的功能，並可根據管理需要向指定的參與者開啟。 傳統網銀也稱第壹代網銀，處於銀行間“各自為政”的狀態，作為第二代支付系統的超級網銀則打破了銀行之間的壁壘。通過壹個操作界面便可查詢多家商業銀行的賬戶情況，還可直接向各銀行發送交易指令。20秒搞定跨行轉賬、實時跨行轉賬和賬戶查詢、在線簽約……超級網銀有著諸多傳統網銀不可比擬的優勢。 超級網銀的另壹個重要功能便是實時到賬。第壹代網銀只有在同壹銀行賬戶轉賬時才能實時入賬，但不同銀行賬戶之間轉賬時，支付指令則要通過付款人開戶銀行網銀支付平臺、人民銀行跨行支付系統、收款人開戶銀行行內業務系統等多級系統，有的環節甚至需要手工幹預，因此跨行轉賬耗時需要壹分鐘到兩三天不等。超級網銀則擁有跨行清算系統，各商業銀行可實現互聯互通，因此跨行轉賬、支付能夠實現實時到賬，單筆業務20秒內即可處理完成。 和多家媒體報道的不同，海南壹銀行相關人士表示，人民銀行做的是面向企業的壹個跨行平臺，企業可以在這個平臺上實現查詢轉賬等功能。“系統已經很成熟了”，該人士表示，至於面向個人的跨行平臺，暫未聽說，“即使有，運行時間應該不會那麽快，至少會在銀行進行模擬測試，然後試運行，之後才能上線，但個人跨行平臺的模擬測試暫時都未聽說。”根據超級網銀的時間表，11月底試點商業銀行將全面上線，屆時海南用戶也將可以試用第二代網銀系統。
另壹銀行人士表示，各個銀行的平臺都不壹樣，銀行之間的接口非常復雜，超級網銀運行後，需要確保銀行系統安全。 “超級網銀就是壹座毛坯房，怎麽裝修，更多的還是要靠第三方支付公司來做。這點銀行沒有我們擅長。國外的花旗和匯豐等大銀行業曾經涉足第三方支付市場，但都做不過美國eBay旗下的電子支付工具PayPal。”易寶支付CEO唐彬說。
第三方支付公司有著銀行不具備的優勢。正如支付寶公司CEO彭蕾所說，壹直以來，支付寶通過自身積累的海量數據搭建整個電子商務的誠信體系。
盡管阿裏巴巴集團CEO馬雲說過，他隨時做好將支付寶送給國家的準備，但支付寶顯然對最終拿到牌照和被允許接入央行超級網銀系統信心十足。
2010年4月，阿裏巴巴集團宣布，未來5年，將對旗下第三方支付平臺支付寶（中國）網絡技術有限公司投資50億元人民幣。不久前，還傳出了支付寶醞釀收購民生銀行以解決支付寶金融融資和牌照問題的消息。
4月底，支付寶實現了杭州市民在手機上和電腦上通過支付寶完成日常的繳費，水費、電費，燃氣費等功能，完成了支付寶走向生活服務的重要壹步。同時，還在上海、重慶、南京等二十多個城市同樣開通支付寶繳費服務。
隨著移動互聯網的發展，手機支付壹直被認為是未來的發展趨勢。連中國移動也通過入股浦發銀行，開始與銀聯爭奪未來手機銀行主導地位。其前掌門人王建宙曾說，中國移動“最缺少的就是金融和傳媒牌照”，可見其對無線支付的重視度。“在移動支付上，有兩種模式。壹是面對面的移動支付，這適合中移動等運營商來發展。二是遠程移動支付，適合第三方支付公司進入。因為現在已經有了Iphone這樣的手機終端平臺。”唐彬說。
支付寶的日交易筆數達到500萬筆，其中手機支付的日交易筆數超過十幾萬筆。2009年支付寶就成立了獨立的無線團隊，專門負責手機支付業務的拓展，加強了對支付寶手機客戶端的開發。
支付寶公關部負責人介紹，阿裏集團新近宣布向支付寶投資的50億元的重要使用方向，便是無線支付領域。而且，支付寶將繼續專註在手機遠程支付領域，包括與手機廠商、操作系統商甚至運營商等加強合作，推動手機支付服務的深化。
相反，似乎在超級網銀上壹時占據了優勢的銀行家們卻顯得有點手足無措。上述民生銀行負責人表示：“移動支付的技術和用戶需求原來都已經有了。但移動和浦發的合作還是讓我們很驚訝於他們對這壹領域布局之快。”