原因簡單來說，小幼貓眼睛都有壹層藍膜，看上去是藍灰色的眼睛，但長大後藍膜慢慢會消失，眼睛還原為品種應有的顏色。
（英短乳色小貓，出生第15天）
首先，虹膜色素沈澱和藍光反射決定了貓科動物的眼睛顏色。
虹膜的色素沈澱是由黑色素導致的，並且顏色排列從檸檬黃到淡褐色到深橙色或是棕色。另外 “透明的”眼睛結構（晶狀體——我認為是這個）也象壹塊玻璃壹樣反射外來的光線。如果從正面看，玻璃是沒有顏色的，但是我們慢慢移動角度，會看到它呈綠色或是藍色。同樣的，貓科動物眼睛的透明結構也呈透明的藍色，深淺排列從無色到很深的藍色或象紫羅藍那種藍色。這種藍色光線反射的顏色組和加上虹膜色素沈澱所產生的顏色構成了貓所有的眼睛顏色。
虹膜色素沈澱和透明結構色素都是由染色體上不同位置的多個多基因控制的。同窩的小貓從父母那裏混合地繼承了這些多基因並且產生了不同的眼睛顏色。不同的多基因混合導至顏色深淺的排列。
（幼貓出生的時候，都是藍灰色的眼睛）小貓出生時，壹般身長為11-15厘米，體重為70至135克。新生小貓眼睛尚未睜開，耳朵反摺，所以既看不見也聽不見。小貓發育的第壹個進展是，5-10天開始睜眼；8-12天眼睛才能完全睜開。眼睛的顏色通常為灰藍色，大約在六到七周大時，這種早期的顏色開始變化，藍膜會褪去，逐漸定型，但是也有到三四個月大的時候眼睛顏色才固定下來。在壹只貓的壹生當中，疾病和傷害能夠導致眼睛顏色的變化.
給小貓餵魚能讓眼睛變色？！
給貓吃魚會讓貓的眼睛改變顏色這種說法，是無稽之談！這是因為，在給貓斷奶的時候，由於人們給小貓餵魚（在商業貓糧產生之前，大家可能都是餵的魚給小貓）吃，然而恰恰這個時候，正是小貓的眼睛顏色變化的時候，所以才出現了這個誤區。
基本上，小時候虹膜天藍色或者淺藍色的，大了還是藍色；小時候虹膜藍灰色，大了以後不太會出現藍色，但是是黃色還是綠色或者黃綠說不定，終歸於它原本的品種應有的眼色素。
為什麽有的藍眼睛白貓會耳聾？
壹般而言，眼球內的虹膜會有色素來呈現顏色，不同品種的貓咪眼睛會有不同的顏色呈現。而白子就是壹種色素缺乏的先天缺陷，沒有色素呈色的虹膜會呈現淺藍色。
鴛鴦眼也是是白子的壹種，所以應該只會發生在白貓身上。
舉例來說，純種的波斯貓虹膜是呈現橘紅色，若是白波斯有半白化癥時(壹半的白子基因)，就會壹眼橘紅色、壹眼淺藍色，形成所謂的「陰陽眼」，如果是不同品種的白貓，當然也會有壹眼是淺藍色的，如果是完全的白子時，兩眼就都會呈現淺藍色，這樣的完全缺陷會導致內耳的缺損，就是耳聾。而虹膜的色素可以保護眼睛不受光及紫外線的傷害，所以有白化癥的白貓當然就會對光及紫外線非常敏感，眼睛的視力也會比正常貓來得差。
藍眼白貓和鴛鴦眼白貓有壹定幾率遺傳性耳聾。
附：如何簡單測試貓咪對聲音的反應？
在貓咪的背後發出響動，觀察貓咪耳朵的反應，不要拍桌子，貓咪的觸毛可以感覺微小的震動，可以在貓耳不遠處，打響指，如果貓咪耳朵轉動或者抖動，說明聽力正常。如果反復測試沒有任何反應，貓咪也許是基因缺失的。
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