“天主教中國主教團”單位：
文學院
* 大眾傳播學研究所
* 教育領導與發展研究所
* 圖書資訊學系暨研究所
* 中國文學系暨研究所
* 歷史學系暨研究所
* 哲學系暨研究所
* 體育學系暨研究所
* 影像傳播學系
* 新聞傳播學系
* 廣告傳播學系
藝術學院
* 音樂學系暨研究所
* 景觀設計學系暨研究所
* 應用美術學系暨研究所
醫學院
* 基礎醫學研究所
* 護理學系暨研究所
* 公***衛生學系暨研究所
* 臨床心理學系暨研究所
* 醫學系
* 職能治療系
聖言會單位：
外語學院
* 比較文學研究所
* 語言學研究所
* 翻譯學研究所
* 英國語文學系暨研究所
* 德語語文學系暨研究所
* 法國語文學系暨研究所
* 西班牙語文學系暨研究所
* 日本語文學系暨研究所
* 意大利語文學系暨研究所
理工學院
* 應用科學與工程研究所
* 電子工程學系暨研究所
* 資訊工程學系暨研究所
* 生命科學系暨研究所
* 化學系暨研究所
* 物理學系暨研究所
* 數學系暨研究所
* 心理學系暨研究所
* 電機工程學系
民生學院
* 博物館學研究所
* 織品服裝學系暨研究所
* 食品科學系暨研究所
* 營養科學系暨研究所
* 兒童與家庭學系暨研究所
* 餐旅管理學系暨研究所
* 流行設計經營系（二年制）
耶穌會單位：
管理學院 （AACSB認證）
* 商學研究所（博士班）
* 金融研究所
* 應用統計研究所
* 管理學研究所
* 信息管理學系暨研究所
* 會計學系暨研究所
* 企業管理學系
* 統計信息學系
* 國際貿易與金融學系
法律學院
* 法律學系暨研究所
* 財經法律學系暨研究所
* 學士後法律學系
社會科學院
* 經濟學系暨研究所
* 社會學系暨研究所
* 社會工作學系暨研究所
* 宗教學系暨研究所
神學院
* 神學系暨研究所
* 教義學系暨研究所
* 全人課程教學中心相關單位
* 專業倫理課程委員會
* 文學院相關單位
* 新莊報導
* 多媒體語言中心
* 天主教史研究中心
* 輔大之聲--FM88.5
* 愛電影人網站
* 生命力公益新聞網
* 媒體與教學資源中心
* 士林哲學研究中心
* 外語學院相關單位
* 視聽教學中心
* 語言中心（華語學習中心）
* 百煉展演中心
* 華裔學誌漢學研究中心
* 管理學院相關單位
* 公司治理與企業倫理研究中心
* 創新育成中心
* 輔仁管理評論
* 法律學院相關單位
* 若望保祿二世和平研究中心
* 法律服務中心
* 民生學院相關單位
* 織品服飾數位博物館
* 輔幼中心
* 社會科學院相關單位
* 原住民服務中心
* 中國社會研究中心
* 理工學院相關單位
* 科學與宗教研究中心
* 生物技術研發中心