“高等教育振興計劃”主要包括有特色高水平高校建設、專業結構調整服務地方發展、教學改革與質量提升、學科建設與研究生教育創新、領軍骨幹人才引進與培育、高校思想政治教育綜合改革、高校創新能力提升與科研成果轉化、創新與公***服務平臺建設、國際合作與開放辦學等九類計劃。 實施有特色高水平高校建設項目、高等教育分類管理與校際合作聯盟建設項目。按照“科學定位、分類指導、多元發展、特色辦學”的高等教育發展方針，重點支持建設壹批高水平大學、具有鮮明辦學特色的應用型本科高校和示範高職院校，推動應用科技大學轉型發展，推動行業高校和民辦院校全面提高教育教學質量，在不同層次、不同類型高校中建成壹批國內壹流的地方高水平高校。探索高等學校分類指導、分類管理規律，引導各類高校科學定位、特色發展。按照“抱團發展、集約辦學”的思路，支持建設若幹個不同類型高校辦學聯盟，引導高校聯盟以項目為載體，深化校企、校地、校際和國際合作，探索***建***贏新模式。
有特色高水平大學建設項目是安徽省高等教育振興計劃的重中之重項目，包括“地方特色高水平大學建設”和“地方應用型高水平大學建設”和“地方技能型高水平大學建設”三項內容。
2013年，安徽省遴選四所高校實施地方特色高水平大學建設，全省十所高校參與競爭。最終安徽農業大學票數最高並成為首批“地方特色高水平大學建設”高校，同時入選首批“地方特色高水平大學建設”項目的還有安徽大學、安徽師範大學和安徽醫科大學。
2014年，安徽省在2013年立項建設四所地方特色高水平大學的基礎上遴選安徽工業大學、安徽理工大學、安徽財經大學和安徽中醫藥大學四所高校第二批進入“地方特色高水平大學建設”項目，遴選安徽科技學院、合肥師範學院、皖西學院、合肥學院、黃山學院、滁州學院六所高校進入“地方應用型高水平大學建設”項目。
實施專業結構優化調整與專業改造項目。主要圍繞地方經濟社會發展對人才培養的需求，加快專業結構調整，支持高校停招、停辦壹批不能適應經濟社會發展需要、就業率低的專業，改造傳統專業，設置並重點建設壹批經濟社會發展急需的專業，積極優化調整專業結構，主動服務和支撐安徽省重大支柱產業或戰略性新興產業發展對高素質人才的需求。
實施高校領軍人才引進和培育資助項目、高校優秀青年骨幹人才基金項目。堅持“服務發展、人才先行、引育並舉、以用為本、質量並重、創新推進”的人才工作方針，重點支持、鼓勵高校引進和培養150名左右在國內外有重要影響的領軍人才，集聚和造就10個左右高水平創新團隊，特別重視培育優秀青年骨幹人才，積極營造人才成長的制度環境和文化氛圍，努力建設壹支師德高尚、數量充足、業務精湛、結構合理、充滿活力的高素質專業化教師隊伍，大力提升高校核心競爭力，促進安徽省高等教育科學發展，為高教強省和美好安徽建設提供人才支撐。 實施中外合作辦學示範項目、“留學安徽”項目。積極拓展國際交流渠道，加強對外交流與合作，提升高校國際化水平。鼓勵高校管理幹部、教師和學生加強與國外高校間的學術交流和人文交流，推進高校開展深度國際合作。積極引進海外優質教育資源和先進教育理念與管理經驗，建設壹批中外合作辦學示範項目。建立來皖留學生激勵機制，吸引更多外國留學生到安徽省高等學校學習和從事科學研究。擴大安徽省外國留學生教育規模，提升我省留學生管理水平和教學質量，擴大安徽教育的國際影響。