後來，前燕被前秦的苻堅消滅，燕國的皇族都倒向了前秦。
苻堅在淝水之戰中戰敗，燕國宗室慕容垂趁機獨立，建立了後燕，算是前燕的繼承者。與此同時，同為燕國宗室的慕容泓建立了西燕，但不久西燕被不在“十六國”之內的後燕吞並。當後燕到達慕容Xi時，慕容寶的養子高雲（慕容雲）在馮巴等人的支持下殺死了慕容Xi並稱帝。不久，高雲被部將殺死，侯巖也死了。馮巴以獨立為契機，建立了北燕。
南燕是慕容寶統治時期從後燕分裂出來的，由燕國宗室慕容德建立，與後燕共存，後被劉武帝所滅。