新疆財經大學作為自治區壹所全日制財經類重點高等院校，現有管理學、經濟學、法學、文學、理學、工學等6大門類，獲批博士學位授予單位和應用經濟學壹級學科博士學位授權點，擁有1個博士壹級學科授權點，1個壹級學科博士後科研流動站、6個碩士壹級學科授權點、26個碩士二級學科授權點、14個專業學位碩士授權點、3個自治區壹級重點學科（其中1個高峰學科，2個高原學科）。現有38個本科專業、4個國家級特色專業建設點、6個國家壹流本科專業建設點、2個自治區壹流本科專業建設點、4個自治區重點專業、4個自治區實驗教學示範中心。