1949年4月，南京解放，國立中央大學農學院教學工作未受影響。1949年8月8日，根據南京軍管會文教委員會通知，國立中央大學更名為國立南京大學。5438+02年6月，國立南京大學理事會成立，中央大學農學院更名為南京大學農學院。
抗戰勝利後，金陵大學遷回南京漢口路原址，9月如期開學。根據華東軍委教育部決定和金陵大學與金陵女子文理學院合並方案，1951年9月，兩校合並為公立金陵大學。至此，金陵大學農學院結束了37年的教會學校歷史。
學校北臨紫金山，西臨明城墻。整個校園與中山陵景區融為壹體，毗鄰全國重點文物保護單位下馬坊。下馬坊是中山風景區的標誌性建築之壹，也是世界文化遺產明陵的重要組成部分。建於1393年(明洪武二十六年)。牌坊造型宏偉，雕刻精美，書法尚可，是明初精美的石雕建築。
1979 1月，中共中央辦公廳發出《關於南京農學院復課的電報指示》。1979 1月，中共農林部黨組、中共江蘇省委聯合提出了《中央關於南京農學院復辦的實施意見》。不久，農林部和江蘇省革委會聯合上報國務院，南京農學院恢復為全國重點大學，實行農林部和江蘇省雙重領導體制。同年，南京農學院在原址恢復建制。