清華大學五道口金融學院實行理事會領導下的院長負責制。理事會搭建起學界與業界的溝通橋梁，為學院在人才培養和學術研究方面引領與滿足行業需求奠定了堅實的基礎。
理事會是學院決策機構，負責通過學院院長、副院長的提名，並對學院重大發展戰略、學科建設目標、發展規劃以及與業界關系密切的教學與科研進行方向性指導。
清華大學五道口金融學院第壹屆理事會成員名單
名譽理事長：
劉鴻儒 中國人民銀行原副行長、中國證券監督管理委員會首任主席
理事長：
吳曉靈 第十壹屆、第十二屆全國人大常委、人大財經委副主任委員、中國人民銀行原副行長
理事（以姓氏拼音為序）：
程建平 清華大學常務副校長
杜金富 中國銀行業監督管理委員會紀委書記、中國人民銀行原副行長
潘功勝 中國人民銀行副行長
萬建華 劉鴻儒金融教育基金會代表、國泰君安證券董事長
王兆星 中國銀行業監督管理委員會副主席
謝維和 清華大學副校長
張誌平 校友代表、香港東英金融集團董事會主席
周延禮 中國保險監督管理委員會副主席
莊心壹 中國證券監督管理委員會副主席