根據查詢鼎牛財經網得知，南京市新農合醫保的繳費截止時間是每年的12月31日，即每年的最後壹天。新型農村合作醫療（簡稱“新農合”）是指由政府組織、引導、支持，農民自願參加，個人、集體和政府多方籌資，以大病統籌為主的農民醫療互助***濟制度。