二者的關系就是吉林財經大學高新校區屬於吉林財經大學下屬的壹個學院。吉林財經大學高新校區主要承辦非統招全日制自考本科的。而吉林財經大學是統招本科院校是通過高考招生的。吉林財經大學高新校區是繼續教育學院，是成人自考院校。
吉林財經大學是吉林省重點大學，是吉林省人民政府與國家稅務總局***同建設的學校。學校起步於1946年7月東北銀行總行舉辦的銀行幹部訓練班。經歷了東北銀行幹部學校、東北銀行專門學校、長春銀行學校、吉林財貿學院、吉林省財貿學校等幾個歷史時期。
截至2016年5月，學校現有教職員工877人，其中專任教師570人，專任教師中具有博士學位的占36.32%，具有高級專業技術職務的占49.82%。專任教師中有教育部"跨世紀優秀人才培養計劃"、"新世紀優秀人才支撐計劃"入選者。