學校的前身是1950年成立的新疆省人民政府幹部學校,1959年升格為新疆財經學院;2000年,原新疆財經學院、新疆經濟管理幹部學院、新疆財政學校含新疆稅務學校合並成立新的新疆財經學院。2007年,正式更名為新疆財經大學。