1、功能差異：同花順免費版的功能相對較基礎，主要提供壹些基本的金融數據服務和功能，如股票行情、財經資訊等。而同花順遠航版在此基礎上增加了更多的專業功能，如九轉序列、牛熊線、超級資金等功能，以滿足更高需求的用戶和機構用戶的需求。
2、界面設計差異：同花順免費版的界面設計較為老舊，與遠航版相比顯得不夠簡潔。而同花順遠航版采用簡潔的風格，所有功能清晰直觀，軟件界面更為清爽。