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安徽財經大學商學院是2003年經安徽省教育廳批準和2004年經國家教育部《教育部關於對安徽省普通高等學校舉辦的獨立院校予以確認的通知》（教發函20047號）確認的獨立學院。在由武書連主持結稿的《2013中國獨立學院評價》中，安徽財經大學商學院被評為中國高水平獨立學院第五名、中國獨立學院性價比排名第4名、本科畢業生質量排名第9名、教師創新能力排名第5名和教師績效排名第4名，同時還名列2013中國獨立學院綜合實力100強，成為安徽省唯壹入圍全國百強的獨立學院。