該院設有財政學、金融學、國際經濟與貿易、經濟學和投資學五個本科專業,擁有國民經濟學、財政學碩士單位授權點。設有:為行政、黨務、教學、學生管理4個職能機構。設有:教學單位財政學、金融學、國際經濟與貿易、經濟學、財經專業基礎等5個教研室。設有:經濟研究所、海西經濟運行效率與風險測評研究中心、城市與區域發展研究所、經濟科學實驗中心、財經文獻資源信息中心和創業教育中心。
國民經濟學專業是集美大學首批四個碩士學位授予點之壹,於2004年正式招生,財政學專業於2007年開始招生。
2011年3月,經國務院學位委員會審議,該院獲得應用經濟學壹級學科碩士學位授權點。該壹級學科碩士點包括國民經濟學、區域經濟學、財政學、金融學、產業經濟學、國際貿易學、統計學、數量經濟學、國防經濟學10個二級學科。2012年,國民經濟學、區域經濟學、財政學、金融學、產業經濟學和國際貿易學等六個二級學科專業同時招收研究生。現有在校本科生2210人,碩士研究生59人。