學院創建於1956，2000年由交通部劃歸山東省，實行中央與地方共建、地方管理為主的管理體制。學校面向全國招生，重點實施本科教育，現已成為以工科為主，交通運輸為骨幹，培養應用型高級人才的多學科普通高等學校。
山東交通大學長清校區包括土木工程學院、信息科學與電氣工程學院、財經學院、管理學院、外國語學院、文法學院、理學院、北方國際學院、水務專業新生部。