區審計局的主要職責是區政府的組成部門，區政府的審計機關，綜合管理全區的審計工作。其主要職責是:組織實施對國家財經政策和宏觀調控措施執行情況的行業審計、專項審計和審計調查。
審計局對藥店突擊檢查的內容為:是否存在假劣藥品，是否存在從非法渠道購進的藥品，常駐藥師是否在崗，處方藥是否註冊，藥品是否按照GSP要求進行分類管理。