1.預申請。申請人應於7月5日-7月29日登錄國家自然科學基金委網絡信息系統16，點擊新建單位登記申請系統進行單位登記預申請。申請人提交預申請三個工作日後將進入申請系統查看受理狀態，預申請通過並獲得受理號後方可填報依托單位登記申請。
2.填寫申請表:申請人應進入申請系統在線填寫申請表，提交電子版後打印紙質申請表1份。紙質申請表原件應與電子版壹致。申請人應當對提交的申請材料的真實性、有效性負責，申請材料中不得含有保密、敏感信息；
3.提交申請材料。申請人應於8月5日16前將完整的申請材料（單面打印、無封面普通裝訂）發送或郵寄至材料接收組。使用郵寄方式的單位，請在截止時間前通過快遞方式寄送，並在信封左下角註明“單位登記申請材料”；
4.申請材料的修改和完成；
5.申請人的審查和批準。自然科學基金委員會將對申請人的基本條件、管理能力和基礎研究能力進行審查，並組織專家進行評審，並於11年底前將批準決定通知申請人。申請人也可登錄科學基金會網絡信息系統查詢審批結果。
法律依據:《國家自然科學基金委員會信息公開管理辦法》第五條。
自然科學基金委員會應當及時、準確地披露信息。如發現影響或可能影響科學基金管理秩序的虛假或不完整信息，應發布準確信息予以澄清。