1959年5月，安徽財經大學建於合肥，時名為安徽財貿學院。
1961年學校遷至素有“珍珠城”美譽之稱的淮河流域中心城市蚌埠，校址設在交通路（現交通路校區）。
1965年學校劃轉中華全國供銷合作總社主管，更名為安徽商學院。
文革期間，學校先後更名為安徽省財經學校、安徽省供銷商業學校。
1978年12月，經國務院批準，學校恢復為安徽財貿學院，由中華全國供銷合作總社與安徽省***同管理，以中華全國供銷合作總社管理為主。
1983年校本部遷至宏業路校區（現龍湖西校區）。
1984年，交通路校區經商業部批準改為商業部安徽商業管理幹部學院。
1992年9月，安徽財貿學院、安徽商業管理幹部學院重組成新的安徽財貿學院，學校先後隸屬於中華全國供銷合作總社、商業部、國內貿易部。
2000年2月，國務院決定，安徽財貿學院實行中央與地方***建，以安徽省人民 *** 管理為主。
2004年5月，經教育部批準更名為安徽財經大學，同年9月，學校校本部遷入龍湖東校區。
2011年安徽省教育廳批復安徽財經大學整體專業進入安徽省本科第壹批次招生。