新疆財經大學商務學院在全國有招生計劃，但屬於民辦三本，跟新疆財經大學沒有關系。
新疆財經大學商務學院是新疆財經大學引入社會良好資金，按新機制、新模式舉辦的本科層次的二級學院，是經自治區教育廳，國家教育部先後審查確認的財經類院校。新疆財經大學商務學院的辦學主體是新疆財經大學 。