克孜勒蘇職業技術學院收費嚴格按照新疆維吾爾自治區物價局核定的標準執行。學費理工科專業3300元/年，文科專業2900元/年，醫學專業3900元/年，金融專業3000元/年，住宿費600元/年。收費標準如有變動，以新疆維吾爾自治區物價局正式批復為準。
壹般來說，由於國家或地方財政資金的支持，國有大學的學費壹般不會很貴。普通專業壹般4000-6000元壹年，藝術專業壹般8000-1萬元壹年。但也有壹些國有大學中外合作等高收費專業，學費通常在壹年兩三萬元甚至幾十萬以上。因為民辦大學需要自籌資金，所以學費壹般都比較貴，通常在每年8000-15000元不等，有的超過每年20000元。