南方大學成立時有六個系，即六個學院。全校有六個系，稱為學院。第壹個是文化教育學院；第二是行政學院；第三是財經學院；第四部分是研究部；第五系是工人民族學院；第六系是華僑學院。
學制暫定為壹至兩年，招收高中畢業或已高中畢業的學生。考試合格後擇優錄取，學習期間享受供應待遇。
學風建設
南方大學制定了“學習理論、轉變思想、鉆研業務”的教育方針；“實事求是”的校風；“忠誠、團結、樸實、謙虛、勤奮、勇敢”是學風，要求師生“緊張工作、努力學習、快樂生活”。
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