1、辦學類型上的區別；
壹般情況下，高職院校主要以職業類教育為主，高專院校以普通類教育為主。但由於歷史原因、現實情況，有些院校雖以高專名義出現，但也慢慢轉向以職業類教育為主。
2、開設專業上的區別；
通常情況下，高專院校主要集中在師範、醫學、公安或某些行業特色鮮明、專業優勢明顯的領域，開設專業必須以國家控制的這些專業為主。
3、畢業證書上的區別；
無論是高等職業教育，還是高等專科教育，學生修完專業所規定的課程、且考試合格者，頒發國家承認學歷的大專畢業證書，但高職的畢業證書會寫為“專科（高職）”字樣，專科僅寫“專科”字樣。
過去，高職高專可能在招生分數、錄取批次、就業推薦上有區別，但現在基本沒有太大區別，二者畢業生享受同等待遇。