從flexner大學畢業後，我先是在家鄉的壹所高中教書，後來按照我建立“學者天堂”的理想創辦了壹所學校。在辦學上，他註重學生的主動性和探索精神，鼓勵學生自我管理，自我學習。人們稱這所學校為“弗萊克斯納先生的學校”。
1905年，他關閉了自己苦心經營了14年的學校，去哈佛大學和德國大學讀研究生。在此期間，他保持了對高等教育研究的興趣。他廣泛吸收了德國經典大學所奉行的“大學是科學研究的場所”的理念，對歐洲尤其是柏林大學的辦學模式有著深刻的認同。
65438-0909年，弗萊克斯納受美國卡內基教學促進基金會的委托，對美國當時的醫學培訓進行了深入調查。他發現大多數醫學院校根本沒有醫學實驗教學，是不負責任的文憑販子。在調查報告中，他提出了壹些關於醫學教育改革的重要建議，這些建議後來大多被政府采納，從而促成了美國壹場卓有成效的醫學教育改革運動。在這場運動中，美國的醫學培訓機構水平得到了顯著提高，並制定了嚴格的醫學培訓標準。
從那以後，flexner被洛克菲勒基金會邀請去做壹些其他的事情，比如為在中國建立北京協和醫院做出貢獻。