2009年9月，吉祥航空榮獲“民航顧客滿意獎”活動。
2009年，10吉祥航空榮獲中國“傑出品牌創新獎”。
2010 1吉祥航空獲得“最具潛力獎”。
2010年3月，吉祥航空榮獲“五壹勞動獎”、“平安單位”、深入學習實踐科學發展觀活動特色成就獎、“巾幗文明示範崗”、“顧客滿意服務之星”等榮譽稱號。
2010年6月，吉祥航空連續獲得“21未來之星——最具成長性的新興企業”和“影響中國優秀品牌獎”兩項大獎。
2010吉祥航空維修工程部浦東基地3號車間被上海市總工會授予“工人先鋒號”榮譽稱號。
2010 11吉祥航空榮獲“2010非凡旅行年度最受歡迎航空公司”稱號。
2011 2月，吉祥航空榮獲“年度最具親和力航空公司獎”。
2012年2月，吉祥航空榮獲“2011非凡之旅最具品牌影響力航空公司”稱號。
2012 11吉祥航空榮獲“2012(第八屆)最佳商業模式中國峰會”十大最佳商業模式獎。
2012 12吉祥航空榮獲“2012年度全國交通運輸企業文化建設優秀單位”稱號。
2012 12 2月，吉祥航空被上海市公安局治安總隊授予“合格公安單位”稱號，同時吉祥航空保衛部被授予“上海市公安先進集體”榮譽稱號。
2013 12吉祥航空榮獲“非凡旅程最佳營銷策劃航空公司”榮譽。
2013年2月，吉祥航空在2012華東區“安康杯”競賽中獲得“優勝企業”，同時餐飲部、機務工程部獲得“優勝團隊”。
2013年5月，吉祥航空榮獲“2011—2012上海市文明單位”榮譽稱號。
2013年5月，吉祥航空在“2013中國商旅人”頒獎典禮上榮獲“最佳客艙服務獎”。