南京工業大學心理健康教育指導中心於2001年5月正式成立，是南方工業大學實施面向全體學生的心理健康教育的專門機構。
承擔著宣傳普及心理健康知識、組織心理健康教育活動、開展心理咨詢和治療、調查大學生心理健康狀況、研究大學生心理健康和心理健康教育的特點和發展規律、指導大學生心理社團工作等任務。通過對大學生進行有效的心理健康教育，可以提升其心理素質，挖掘其智力潛能，培養健康人格，提高其適應能力，預防和消除心理障礙，促進其健康成長。
中心以指導和幫助全體學生提高心理素質為宗旨，倡導“關愛心靈，關註健康”的理念，采取面點結合的教育策略，既註重全體學生的心理教育(開設系列課程、講座、沙龍、團體培訓)；關註個別學生的心理咨詢(專業心理測試、面試、電話咨詢、網上咨詢)，為學生解決學習、交友、情感、擇業等方面的問題，幫助學生完善人格，提高心理素質，增強適應環境、承受挫折、發展自我的能力；逐步構建課內與課外、教育與引導、咨詢與自助緊密結合、與學校合作促進學生全面和諧發展的心理健康教育網絡和體系。
該中心隸屬於南方理工大學大學生事務部，采取專職與兼職相結合的工作制度，充分發揮專家、教授、德育工作者、醫生在心理教育中的積極作用，特別是優秀學生誌願者和學生社團，全方位開展教育、研究和咨詢工作。