雲南省國家稅務局成立1994，機構設置、幹部管理、人員編制和經費支出由中華人民共和國國家稅務總局垂直管理。屬於正廳級(局)級國家機關，省局機關內設25個處級機構(辦公室、人事處、教育處、監察室、巡視辦、黨委辦公室)。
工會、離退休幹部辦公室、貨物和勞務稅辦公室、所得稅辦公室、征管辦公室、科技發展辦公室、納稅服務辦公室、收入規劃會計辦公室、財務管理辦公室、督察內審辦公室、政策法規辦公室、大型企業和國際稅收管理辦公室、稽查局、信息中心、代理服務中心、稅務科學研究所。
註冊稅務師管理中心、稅務學會、雲南稅務幹部學校、中國稅務報社駐雲南記者站)，全國有16個州、市國稅局，137個縣、市、區國稅局，215個稅務分局。
主要職責
壹、貫徹執行國家稅收法律、法規和規章，並結合雲南實際，研究制定具體實施辦法。
二、根據雲南經濟發展規劃，研究制定本系統稅收發展規劃和年度工作計劃並組織實施。
三、根據經濟稅源和國家稅務總局下達的稅收計劃，編制、分配和分配本系統稅收收入計劃並組織實施。
四、負責地方中央稅和中央與地方所享稅收的征收、管理和檢查；負責增值稅專用發票、普通發票及其他稅務憑證的管理。
五、負責本系統稅收執法的監督檢查；負責稅務行政處罰聽證、行政復議和訴訟。
六、負責地方進出口稅收和涉外稅收管理。
七、負責本系統的稅收核算和統計。
八、負責系統資金、財務、基建和資產管理、審計和政府采購工作。
九、負責系統組織、編制和人員管理。
十、負責本系統的思想政治工作、精神文明建設和基層建設，負責教育培訓管理。
十壹、負責本系統的紀檢監察工作。
十二、負責稅務信息系統的規劃和實施，信息系統的現代化建設和管理。
十三、學習稅收理論和稅收政策，分析稅收信息，掌握稅收動態。組織稅法宣傳。
14.承辦國家稅務總局和雲南省委、省政府交辦的其他工作。
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