境內四面環山，丘陵起伏，山少，地貌復雜。以丘陵為主體的山地占總面積的512.7%，丘陵占10.1%，平地占28.1%。境內山川河谷呈西北-東南走向，地勢西北、西南略高，向東傾斜。中部被左江、右江、郁江及其支流切割，形成錯判的丘陵平原。東北部的大明山是中國最高峰，海拔1760米。有10多座1000米以上的主峰，如東部的鎮龍山，西部的大明山和四成嶺，南部的大青山和宮木山。
南寧地質構造古老，以泥盆紀、二疊紀、三疊紀為地質基礎，以石灰巖為主，頁巖、砂巖次之，地表覆蓋第四紀紅土。中國的河流屬於西江水系。郁江、左江、右江為幹流，從西南、西北、東三個方向切割，流經中部，形成大小河網。
全區集雨面積在50平方公裏以上的河流有113條，河流面積92400平方公裏，其中左江幹流長539公裏，流域面積31595平方公裏，年平均流量174億立方米。右江幹流長707公裏，流域面積38612平方公裏，年平均流量145億立方米。
南寧的地形是以邕江流域為中心的盆地形狀。
這壹盆地向東開闊，南、北、西三面環山，北有高峰嶺低山，南有七坡高丘，西有鳳凰山(西大明山東山)。形成了西起鳳凰山，東至青秀山的長谷盆地。流域中心成為河流的集中地，西北來右江，西南來左江，南來涼風江，北來新圩江，形成向心水系。在盆地中部，即左右兩河交匯處，南北兩側的丘陵緊貼河岸，形成天然的分界線，把長谷和盆地分成兩個小盆地，壹個是以南寧為中心的邕江河谷盆地；二是以壇洛鎮為中心的侵蝕-溶蝕盆地。
南寧的地貌分為五種類型:平地、低山、石山、丘陵和階地。
平地是南寧最大的地貌類型，面積1，037.33平方公裏，占全市總面積的57.78%。分布在左右江下遊交匯處和邕江兩岸。
低山總面積82.64平方公裏，占全市面積的4.6%。它分布在城市西部邊緣的鳳凰山。是壹座海拔300-600米，坡度25-40度的圓頂山。高峰嶺，位於城市北部，是壹系列褶皺的低山，呈東北-西南走向，壹般海拔250-450米，坡度20-40度。
落基山面積46.7平方公裏，占總面積的2.61%。主要分布在西北邊緣和壇洛鎮周邊，分為峰林石山和孤峰石山兩大類。峰林落基山海拔300-400米，山谷海拔120-160米。
谷峰的落基山壹般海拔200-250米，平地海拔80-100米。丘陵面積279.86平方公裏，占全市面積的15.59%。
臺地多為第三系侵蝕面，有輕微切割和平緩起伏。海拔在1.20米以下，為低級古侵蝕面，壹般為緩坡起伏，頂面齊平。