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復旦大學創建於1905，原名復旦學院。“復旦”壹詞選自《尚書·夏宇傳》中的名句“日月爭輝，復旦欣欣向榮”，其創立者、中國近代著名教育家馬先生，意在自強不息。
1937抗戰爆發後，學校遷至重慶北碚，1941改為國立大學。1946遷回上海江灣原址。從65438到0952，復旦大學成為教育部領導下的全國重點綜合性大學。2000年4月，復旦大學與上海醫科大學合並，組建新的復旦大學。
經過百年來復旦人的不懈努力，特別是近六個五年計劃中的重點建設，復旦大學現已成為壹所多學科的綜合性大學，形成了“壹體兩翼”的校園格局:即邯校區和江灣校區為壹體，林峰校區和張江校區為兩翼。
截至2012年末，學校擁有28個直屬院系，34個博士後科研流動站，11個壹級學科國家重點學科，19個二級學科國家重點學科，5個國家重點實驗室，4個教育部工程研究中心，12個教育部重點實驗室，9個衛生部重點實驗室，後勤部衛生部。
學校擁有壹支高水平的師資隊伍，其中博士生導師1402人，碩士生導師1708人，中國科學院、中國工程院院士37人，教育部長江學者獎勵計劃特聘教授62人，國家重點基礎研究發展計劃(含重大科研計劃)講師35人，首席科學家29人。
學校還擁有中山醫院、華山醫院等10附屬醫院，為培養高層次醫學人才創造了良好的條件。