學校秉承“研究型學校”和“科研興教”的發展戰略，高度重視教育教學和科研工作，獨立承擔了中央電化教育館“網絡環境下學習方式和教學模式的構建與創新”課題和省教育規劃辦“信息技術與學科教學整合研究”課題。參與了“網絡環境下基礎教育跨越式發展與創新實驗研究”、“小學語文教育發展與創新研究”等“十五”重點項目，培養了壹大批教研人才和教學專家。
學校高度重視校園文化建設，大力推廣和開發校本課程，全面推進和實施素質教育。學校少先隊工作和體育、文化、藝術教育卓有成效，對學校的教育教學起到了積極的推動和引導作用。豐富多彩的第二課堂有效活躍了校園氣氛，提高了學生的綜合素質。2001年，我校少先隊成績顯著，被評為深圳市優秀大隊。我校鼓隊代表南山區參加深圳市人物操遊行，獲得壹等獎。“南山人愛南山”綜合實踐活動已成為我校響亮的招牌；英語戲劇社、無憂文學社、小發明家工作站等校本課程的開設，日益凸顯了師生的個性與智慧。
目前，南山小學正高舉“懂教育”的旗幟，解放思想，開拓創新，以創建“和諧優質校園”為契機，全面建設優質示範小學，努力滿足公眾對優質教育的需求，辦好人民滿意的教育。