出版專著《工程造價管理的理論與方法》和教材《建設工程計價》，發表了《建設工程設計招投標制度》、《施工企業機械設備租賃與購置的經濟比較》、《水電工程投資控制理論與方法探討》、《建設工程設計階段及其投資控制的特點》、《工程投標中價格的形成機理及主要影響因素》、《建設工程投資》等幾個重點問題。工程價格概念的比較、工程造價管理學科的產生與發展、研究方法、價值工程在優化設計中的應用、作業成本法在施工企業管理中的應用探討、工程造價與進度的偏差分析、工程量清單計價模式下評標方法的初步研究、總承包企業與工程管理企業的比較、工程施工資源的動態規劃與優化配置、 《基於人工神經網絡和多指標綜合的配電網建設經濟後評價》、《總承包企業與項目管理企業的比較》等學術研究論文30余篇。 近年主持完成“溪洛渡工程定額測試與分析”(三峽開發公司)、“水電造價工程師知識結構與教材研究”(三峽開發公司)、“水利工程排水減災效益評價模型研究”(湖北省水利廳)、“黑水河毛爾蓋水電站可行性研究專題”、“西藏拉薩河紮雪水電站可行性研究專題”(國電公司成都勘測設計院)等科研項目。郭琦教授現任三峽大學經濟管理學院黨委書記，是三峽大學“151”人才“管理科學與工程”學科帶頭人。“管理科學與工程”博士點負責人獲中國建設工程造價管理協會優秀論文獎、湖北省水電工程學會理論成果二等獎、學校科技進步壹等獎。