在計算企業所得稅應納稅所得額時，允許扣除的稅種包括消費稅/土地增值稅/城鎮土地使用稅。根據規定，允許稅前扣除的稅種包括消費稅、營業稅、資源稅、關稅、城市維護建設稅、教育費附加、土地增值稅、房產稅和印花稅，但不包括增值稅。
為農業生產產前、產中、產後服務的農村行業，即農村農業推廣站、植保站、水管站、林業站、畜牧獸醫站、水產站。生活站、氣象站、農民專業技術協會和專業合作社，對其提供技術服務或勞務取得的所得，以及其他城鎮機構開展技術服務或勞務取得的所得，暫免征收所得稅；
為各行業服務的科研單位和大專院校進行技術成果轉讓、技術培訓和技術咨詢。技術服務和技術承包所得暫免征收所得稅；新設立的從事咨詢(包括科技、法律、會計、審計、稅務等咨詢)的獨立核算企業或經營單位。)，信息產業和技術服務業。
自開業之日起免征所得稅2年；新設立的獨立核算企業或者從事交通、郵電通信的經營單位，自開業之日起，第壹年免征所得稅，第二年減半征收所得稅；
新設立的獨立會計師分別從事公用事業、商業、物資行業、外貿行業、旅遊、倉儲業、居民服務業、餐飲業、教育和文化事業。從事衛生事業的企業或經營單位，經主管稅務機關批準，自開業之日起，可減征或免征所得稅兩年。