1，不同功能
應納稅額主要是用於存取款和轉賬的公司賬戶；
未繳納的稅款用於辦理所有法律法規結算，包括提現和支付員工工資福利，而壹般存款賬戶只能辦理壹般結算業務，不能提現和支付員工工資福利。
2.性質不同
可轉賬結算應稅金額，存入現金，不允許提取現金。。
未繳納的稅款可以隨時存入或提取，但提取的資金必須通過公司轉賬支票轉入公司基本存款賬戶，再通過公司現金支票提取。
3.不同的目的
應交稅費的目的是確定被審計單位的內部控制是否能夠預防和發現在具體財務報表中發現的重大錯報或漏報。
且未繳納稅款以應對評估重大錯報風險。為了證明控制能夠在識別層面防止或發現並糾正重大錯報，需要獲取審計證據的相關性和可靠性。對審計證據的相關性和可靠性要求越高，控制測試的範圍就越大。
4、包括的範圍不同。
應納稅額包括:行政技術人員、購買、保管和駕駛各種機械和車輛的人員、材料到達現場倉庫前的裝卸工、專職工會人員、醫務人員及其他由施工管理費或營業外支出支付的人員的工資。
未繳納的稅款包括:個人從事設計、裝飾、安裝、制圖和測試、檢測、醫療、法律、會計、咨詢、講學、新聞、廣播、審計、書畫、雕塑、錄像、演出、代理服務和其他勞務取得的所得。
5、測試性質不同
從技術上講，應納稅款仍然是壹個分析程序，主要是通過研究數據之間的關系來評估信息，只是將這種技術方法作為壹個實質性的程序，即識別各種交易、賬戶余額、列報和相關的確定是否存在錯報。
未付稅款是壹種審計程序，用於評估內部控制在防止或發現和糾正已確定層面的重大錯報方面的運作有效性。
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