圍繞這艘沈船，還出現了壹個至今專家也無法完全解釋的現象。陳悅說，考古學家發現沈船的整個甲板上都覆蓋著壹層石頭，而且這些石頭非常巨大。為什麽這些大石頭會出現在沈船的甲板上？
薩蘇說，有可能是日本用石頭壓住船體，防止沈船被水流沖走。然而，陳悅同意另壹種觀點，即日本人用石頭來壓制中國的風水。陳悅說，有專家提出，日本人熟悉中國的風水文化，在船上放石頭會破壞中國的風水，同時也意味著北洋水師乃至中國的永世不得翻身。據說在甲午戰爭後吞並朝鮮的過程中，日本還把鋼筋釘進朝鮮的宮殿和大山裏，意圖切斷朝鮮的“龍脈”。
薩蘇不同意這種說法，但陳悅也提出了另壹種解釋:當時有壹種打撈沈船的方法，就是先把石雕傾倒，然後靠石雕的重力把它浮起來。所以這些石頭可能是日方在打撈沈船時用過的，但打撈計劃因故取消後，所有石頭都被傾倒在船上。
陳悅說，更多的考古發掘和文獻解讀有望解開這艘中日沈船上的石雕之謎。
鍋爐罩能解開致遠艦沈沒之謎嗎
黃海決戰，致遠艦沈沒，朝野震驚。光緒皇帝曾為鄧世昌的書寫了壹副挽聯:“此日滿眼淚，有強大的海軍力量！”然而致遠艦是如何沈沒的，至今仍是個謎。廣為流傳的是魚雷擊沈，即戰爭期間，鄧世昌率艦對日吉野艦，致遠艦卻被魚雷擊中而沈沒。但致遠艦沈沒時，與日艦的距離還沒有進入魚雷的有效射程，否則致遠艦很可能已經對日艦發動了魚雷攻擊。
近年來研究分析，致遠艦沈沒很可能是由於鍋爐當天在吃水線附近被日軍大口徑火炮擊中，導致大爆炸而沈沒。另壹種解釋是致遠艦沈沒是因為船內水太多，海水湧入鍋爐房，引發大爆炸。
無獨有偶，在之前的水下考古中，也發現了壹個直徑2米的鍋爐蓋子，而這個蓋子是在距離船體30米的地方發現的。陳悅說，致遠艦沈沒的真正原因需要被發現和證明。