近年來，體育科學研究所的發展突飛猛進，工作卓有成效。65438-0998，獲得“體育教育與訓練”碩士學位。1999新開設了“社會體育”專業，實現了從壹個專業到兩個專業的跨越。2000年獲得“課程與教學論”(體育課程與教學論方向)博士培養資格。2001獲得“教育碩士”(體育)授權點資格，被教育部授予“國家體育藝術教師培訓基地”。2002年獲全國體育專業大學生基本功大賽壹等獎。2003年獲“體育人文社會學”碩士學位，被國家體育總局授予“體育社會科學國家重點研究基地”。2004年，4篇論文入選雅典奧林匹克科學大會，1篇論文入選亞洲體育論壇，17篇論文入選第七屆全國體育科學大會，6篇論文入選第四屆全國大學生運動會體育科學論文報告會。2005年成功申報“體育人文社會學”博士點、“體育學壹級學科”碩士點、“體育人體科學”碩士點；“社會體育本科專業”擁有學士學位授予權；體育專業是全省首家開設“體育自考”的單位。2006年，田玉普教授獲得國家體育總局年度科技進步壹等獎。2007年19篇論文入選第八屆全國體育科學大會，以此類推。
學科建設取得顯著成績，形成了博士、碩士、教育碩士、本科、繼續體育教育相銜接的多層次辦學格局。建立了通用課程、平臺課程、專業課程、自主開發課程的模塊化課程體系，構建了必修、必修、選修、跨學科、理論與實踐相滲透的較為完善的學科體系。
師資隊伍建設卓有成效。
科研成果豐碩，獲省優秀教學成果壹等獎2項，校級教學、教材、教育、雙優、優秀講座獎20余項。出版教材和專著32部，發表論文1000余篇，展現了學院教師良好的精神面貌、工作熱情、科學態度和學術水平。
南京師範大學體育科學學院將圍繞創建綜合性、有特色的教學研究型大學的目標，堅持內涵提升與外延拓展協調發展，走可持續發展之路，著力解決教師目標定位問題，處理好辦學規模、結構、質量和效益的關系，努力提高以人為本的本科和研究生教育質量。